图论分析方法gretna_预计的数据分析流程以及一些问题

1.数据预处理(到smooth)

SPM12 (去掉前10层，时间层校正，头动校正，功能像结构像对齐，结构像分割，Normalise到标准空间，Smooth)

2.数据预处理之detrend和filter，回归掉CSF和WM的协变量，然后用Scrubbing(？)去头动伪迹

GRETNA(大概需要整理一下文件夹的结构，所以这个软件需要的文件夹结构是怎样？)

或者DPARSF或者REST，GRETNA使用scrubbing去头动伪迹，但是这一方法可能会影响degree centrality，所以打算先不用。最后我采用的是DPARSF来去线性趋势(detrend)，去除协变量，以及滤波(filter)(参数如下图)

注意：我运行到去除协变量这一步之后出现了"undefined function：file2mat" 这样的错误，这个时候的解决办法我查了一下说是可以重新设置SPM12的路径，但是重新设置之后还是没有用，原因是file2mat.m文件在SPM12中是在@开头的文件夹中。这种文件夹不会被添加到路径中。所以我就把含有file2mat.m的那个文件夹(可以在SPM12文件夹中使用find来查找这个文件在哪里)中的全部内容复制出来，在SPM12的路径中新建了一个新的文件夹，把这些文件都复制进去，然后在matlab中添加这个文件夹的路径。解决了问题