脑网络分析软件Gretna操作--Network Analysis

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文章标签： 图像处理 拓扑学 医学影像 核磁
于 2018-10-25 15:03:31 首次发布
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分析网络的各项属性

在这里插入图片描述
选项从上至下包括网络小世界属性,网络传输效率,富人俱乐部,网络同配性,同步性以及层级性

在这里插入图片描述进入界面后在左下方可以添加想要分析的各项属性在这里插入图片描述
从上至下依次为节点聚类系数,最短路径长度,节点效率,节点局部效率,中心度,介数中心性,社团指数,参与系数.
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有两种模块化算法可供选择:
1.贪心算法 2.谱优化算法

裤裤兔
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利用gretna计算小世界网络属性等图论指标笔记
weixin_52073820的博客
05-04 1万+
提示：文章写完后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档 文章目录前言总结 前言 gretna是一个基于图论进行脑网络分析（包括结构和功能网络）的工具包，前面我已经使用FSL和PANDA得到了FA矩阵，那么接下来我就使用FA矩阵进行图论分析，计算结构网络的网络拓扑属性包括:聚类系数(clustering coefficient)、最短路径长度(shortest path length)、小世界属性包括标准化聚类系数(normalized clustering coefficient)、标准化最短
如何利用gretna软件计算脑网络全局属性(聚类系数，小世界属性，最短路径)，局部属性指标（度，度分布，节点效率），如何理解网络稀疏度
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
06-04 7000
grena工具箱被设计用于fMRI数据的图论网络分析。它是一套MATLAB函数和基于MATLAB的接口，用于常规的fMRI预处理，用于计算和统计分析最常用的网络指标，如小世界参数、效率、度、间性、关联性、层级性、同步性和模块化。......
gretna软件讲解中文机翻版.pdf
12-27
gretna软件的manual是英文的，用有道词典翻译成中文版，然后粘贴在一起，变成这个版本。这个是机器翻译版，一些常见的错误还没来得及改正（比如“学位中心度”其实是“介数中心度”），大家将就下。
GRETNA:MATLAB 中的图论网络分析工具包-matlab开发
06-01
基于从 fMRI、sMRI 或 dMRI 数据获得的网络矩阵的图论网络分析工具包。 GRETNA 包含以下几个主要功能： (i) 具有图形用户界面 (GUI) 的开源、跨平台（Windows 和 UNIX 操作系统）软件包； (ii) 允许具有并行计算能力的全局和局部网络特性的拓扑分析，独立于成像模式和物种； (iii) 在网络构建和分析的几个关键步骤中提供灵活的操作，包括网络节点定义、网络连通性处理、网络类型选择和阈值程序的选择； (iv) 允许对全局、节点和连接网络指标进行统计比较，并评估这些网络指标与感兴趣的临床或行为变量之间的关系； (v) 包括基于静息状态功能 MRI 数据的图像预处理和网络构建功能。
A Graph-theoretical Network Analysis Toolkit in MATLAB.zip
07-23
本文将详细介绍名为“GRETNA”（Graph-theoretical Network Analysis Toolkit）的MATLAB工具包，它为用户提供了全面的图论网络分析功能。 GRETNA是基于MATLAB开发的一个开源工具包，主要用于网络的构建、分析和可视...
GRETNA-2.0.0_release.zip
04-27
其强大的分析工具，如功率谱分析、相干性分析以及独立成分分析（ICA），可以帮助研究人员揭示大脑网络的动态变化和连接模式。 除了核心的分析功能，GRENTA可能还包含可视化组件，如头皮电位图、源定位图像等，这些...
biogeme program and manual 程序、示例和操作手册
05-08
离散选择 discrete logit probit choice 示例 程序手册 英文程序 英文说明
MATLAB图像处理工具箱用户手册
06-08
采用matlab实现图像处理必备书籍，很详细的步骤描述
GRETNA使用流程
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Iris_bysshqx17的博客
09-16 1万+
准备 首先，我是从GRETNA的Github官网上下载的GRETNA-master这个版本。 其次，安装的方法就是解压，然后把解压的文件夹添加到matlab的路径中，注意路径不要有中文，特殊符号或者空格。 第三，我没有使用GRETNA来做数据的预处理。作为参考我的预处理是通过SPM12和DPARSF来完成的。最后使用的文件夹FunImgARWSDCF中每个被试一个文件夹，一个文件夹中一个Filte...
图论分析方法gretna_预计的数据分析流程以及一些问题
weixin_36378771的博客
01-17 7052
1.数据预处理(到smooth)SPM12 (去掉前10层，时间层校正，头动校正，功能像结构像对齐，结构像分割，Normalise到标准空间，Smooth)2.数据预处理之detrend和filter，回归掉CSF和WM的协变量，然后用Scrubbing(？)去头动伪迹GRETNA(大概需要整理一下文件夹的结构，所以这个软件需要的文件夹结构是怎样？)或者DPARSF或者REST，GRETNA使用s...
gretna输入文件格式
weixin_51192938的博客
09-01 935
对于IMA文件格式的DCM文件，gretna不能使用dcm2nii，需要手动使用mricron转格式功能，IMA格式转换为nii格式SPM8（3D Nifiti）格式，，然后把转换好的960张3Dnii文件放在~/sub01/FunImg/xxxx.nii/路径下。
来看看机翻大神们的翻译....机翻很强大....晕死大家(更新了)
weixin_33834679的博客
11-26 388
更多: http://tieba.baidu.com/f?kz=445160658 晕，手头正好有华联的一次性杯，真是那样写的，晕 转载于:https://www.cnblogs.com/javabluesky/archive/2008/11/26/2211725.html...
基于Gretna计算小世界网络属性等图论指标
qq_42795316的博客
04-19 5980
基于Gretna计算小世界网络属性等图论指标
Gretna计算网络指标操作
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03-10 4267
gretna计算网络属性
Gretna分析预处理fMRI文件导入一直报错是怎么回事
qq_42015033的博客
06-12 527
在我导入DICOM文件时，一直不成功，重新安装软件，配置路径也不成功，到底怎么解决，谁来帮帮我（弱小哭泣）
Rich-club计算
qq_42795316的博客
07-06 1140
Gretna计算richclub的结果解释及进一步计算
gretna计算功能脑网络属性
最新发布
01-25
Gretna是一个用于分析和计算功能脑网络属性的工具。它基于脑网络理论和计算机科学的原理，可以对功能脑网络进行定量分析和计算。功能脑网络是指由大脑区域之间的相互作用组成的复杂网络，可以通过不同的计算方法来描述和分析。 Gretna具有以下主要功能： 1.网络构建：通过脑成像数据，Gretna能构建功能脑网络。它可以将脑图像数据转换为具有节点和边的网络结构，节点代表大脑区域，边代表区域之间的连接。通过网络构建，我们可以获得具体的功能脑网络结构。 2.网络属性计算：Gretna提供了许多常用的网络属性计算方法，如度中心性、聚类系数、介数中心性等。这些属性可以量化网络的重要性和特征，帮助我们理解功能脑网络的复杂性与协同性。 3.统计分析：Gretna还提供了一系列统计分析方法，用于比较不同组之间的功能脑网络差异。例如，可以通过网络属性的统计显著性测试，来研究疾病群体与正常群体之间的不同。 4.可视化：Gretna能够生成可视化的网络图和统计结果。通过可视化，我们可以更直观地观察功能脑网络的结构和性质。 总的来说，Gretna是一个功能强大的工具，可以帮助研究者深入研究和理解功能脑网络的属性。它的使用可以促进我们对大脑的认识，进一步推动神经科学的研究和发展。
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