clustalw序列比对_如何做出漂亮的序列比对图——ENDscript/ESPript

最新推荐文章于 2024-07-10 10:50:19 发布
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文章标签： clustalw序列比对
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本文介绍了如何使用ClustalW进行序列比对，并通过ENDscript/ESPript创建高质量的序列比对图形。详细步骤包括在ClustalW网站上进行比对，下载结果文件，然后在ENDscript/ESPript中上传文件并生成图像。文章还提到了可能遇到的问题及解决方法，如浏览器设置和文件下载问题。
摘要由CSDN通过智能技术生成

以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！

如何做出漂亮的序列比对图——ENDscript/ESPript

大家经常在文献中看到非常好看的序列比对图，现在笔者将目前见过的最好看的序列比对图的作图方法作分享，希望对大家的科研工作有所帮助，效果图如下：

3bd5b16bb917b69c6e49e3a400b444ea.png
  1. 在蛋白质数据、Genbank、Uniprot等数据库搜索得到蛋白质序列，本例分别采用PDB ID为3L3U和3OYA的蛋白质序列的A链作比对，并得到序列比对图；
  2. 打开ClustalW网站，采用Clustal算法进行序列比对，输入格式如下，点击Execute Multiple Alignment进行序列比对；

0b7ed9533866735ee8f5fdc47e133802.png

3、比对完成后，会自动弹出结果页面，点击clustalw.aln下载该序列比对文件，该文件即包含了两个序列的比对结果；

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