clustalw序列比对_序列比对软件

科研路上的你是不是经常会遇到序列比对的工作，你所知道的序列比对是否能满足你的需求呢？

今天小编特意给大家整理分享了有关序列比对综合分析的软件，聪明的你们快来试试有没有心仪的软件工具。

Geneious         序列综合分析软件(https://www.geneious.com/)

ClustalW  2.1

用来对核酸与蛋白序列进行多序列比对(multiple sequence alignment)的软件。(https://clustalw.ddbj.nig.ac.jp/)

FASTA   将一条序列与另一条序列进行比较或在数据库中查找同源序列并输出。

FASTA软件包包含用于蛋白质：蛋白质，DNA：DNA，蛋白质：翻译的DNA(具有移码)以及有序或无序肽搜索的程序。FASTA软件包的最新版本包括特殊翻译的搜索算法，当将核苷酸与蛋白质序列数据进行比较时，该算法可以正确处理移码错误(六帧翻译的搜索不能很好地处理)。

除了快速的启发式搜索方法外，FASTA软件包还提供SSEARCH，这是最佳Smith-Waterman算法的实现。

该软件包的主要重点是计算精确的相似性统计数据，以便生物学家可以判断是否可能偶然发生了比对，或者是否可以用来推论同源性。

用作此软件输入的FASTA文件格式现在已被其他序列数据库搜索工具(例如BLAST)和序列比对程序(Clustal，T-Coffee等)广泛使用。

BLAST+  

分成五个不同的程序，分别为：blastp(提交蛋白质序列，在蛋白质序列数据库中查序列)、blastn(提交核酸序列，在核酸序列数据库中查找同源序列) blastx(提交核酸序列，在蛋白质序列数据库中查找同源序列)、tblastn (提交蛋白质序列，在核酸序列数据库中查找同源序列)、tblastx(提交核酸序列，在核酸序列数据库中查找同源序列)。

IGV   显示分析多种类型的遗传数据软件 (https://igv.org/)

腊八已过，年味渐浓，希望大家在新的一年量产科研成果！

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