森林图怎么分析_赠书随机生存森林模型

本文介绍了如何分析森林图,特别是通过Kaplan-Meier模型展示随机生存森林中每个树的生存函数曲线。变量importance揭示了sex和ph.karno的重要性。此外,展示了如何使用ranger库预测新数据的生存曲线,提供了一种预测新样本生存状态的方法。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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随着机器学习的发展,机器学习模型被应用与生存分析的问题上,其中包括生存森 林模型。有几个包可以实现随机生存森林,包括ranger,randomForestSRC。本章节是通过ranger实现随机森林模型。 随机生存森林模型通过ranger函数构建,ranger()为数据集中的每个观察建立一个模型。下一个代码块使用上面Cox模型中使用的相同数据以及变量构建模型,并绘制20条随机曲线,以及表示所有患者的全局平均值的曲线。使用ranger构建随机森林模型,第一个参数依然是公式,公式的左边是一个生存对象。第二个参数是data,表示用于建模的数据集。第三个参数是mtry,用于表示所选取的特征数目,第四个参数importance用于指定变量重要性的模型。第五个参数splitrule用于指定决策树的划分指标。第六个参数verbose表示是否显示出运行状态。然后,结果曲线如图4.14所示。
library(ranger)r_fit                  ph.karno + wt.loss, data = na.omit(lung),                     mtry = 4,                     importance = "permutation",                     splitrule = "extratrees",                     verbose = TRUE)# Average the survival modelsdeath_times surv_prob avg
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