nexus比对格式
#NEXUS
BEGIN DATA;
dimensions ntax=4 nchar=28;
format missing=?
interleave=yes datatype=DNA gap=- match=.;
matrix
ccsA1 ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
ccsA2 ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
ccsA3 ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
ccsA4 ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
;
end;
fasta格式
>ccsA1
ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
>ccsA2
ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
>ccsA3
ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
>ccsA4
ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
**
nexus比对格式
#NEXUS
BEGIN DATA;
dimensions ntax=4 nchar=28;
format missing=?
interleave=yes datatype=DNA gap=- match=.;
matrix
ccsA1 ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
ccsA2 ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
ccsA3 ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
ccsA4 ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
;
end;
fasta格式
>ccsA1
ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
>ccsA2
ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
>ccsA3
ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
>ccsA4
ATGATATTTTCAACTTTAGAGCATATAT
**不同的比对