典型相关分析(cca)原理_全网最细的图文详解——手把手教你不会代码一样做RDA/CCA分析！...

在进行微生物多样性分析时，大家一定会想做微生物群落与环境因子之间的关联性分析，其中RDA分析便能帮助我们解析微生物群落与环境因子之间的相关性问题。

RDA分析即冗余分析，是环境因子约束化的PCA分析，可以将样本和环境因子反映在同一个二维排序图上，从图中可以直观地看出样本分布和环境因子间的关系。CCA分析是基于对应分析发展而来的一种排序方法，将对应分析与多元回归分析相结合，每一步计算均与环境因子进行回归，又称多元直接梯度分析。此分析主要用来反映菌群与环境因子之间关系。RDA是基于线性模型，CCA是基于单峰模型。分析可以检测环境因子、样本、菌群三者间的关系或者两两之间的关系。

RDA分析-

Canoco 5

Canoco是一套在生态学及几个相关领域内使用ordination methods来进行多变量统计分析的最常用程序包。

使用教程

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准备物种数据与环境数据，至于物种数据在门水平或者其他水平读者自行选取，本文以属水平为例。