R语言：冗余RDA分析（结合回归和主成分分多元的排序方法）+置换检验+变差分解图

冗余RDA分析

• 结合回归分析和主成分分析的排序方法

• 使用：vegan包的rda()函数

• 数据准备：变量之间要一一对应（比如都为30个样方）

• 绘制RDA排序图（参数设置）

参考R语言实践第三章：图形初阶

RDA结果的置换检验：anova()

• 注意：与方差检验无关

偏RDA分析

变量的共线性程度检验：方差膨胀因子VIF

（1）vif.cca()函数允许RDA包含因子变量

（2）生态学中RDA变量选择的3个函数

①forward.sel()：不能直接分析因子变量；

②ordistep()：【优选】

• 可以分析因子变量，也可以前向、后向和组合选择

• 适用于RDA、CCA分析

③ordiR2step()：不可后向，局限用于RDA分析

（3）偏RDA变量前向选择：ordistep()和ordiR2step()

变量分解

• 量化两组或多组变量单独及共同解释的方差（使用校正的R2）