R语言做GGEbiplot_科学网-怎么用R语言做GGE Biplot双标图(how to)(代码分享及结果解读-邓飞的博文...

本文介绍了如何使用R语言制作GGE Biplot双标图,包括Which-Won-Where View、Environmental Vector View、Discriminating Ability VS Representativeness View和Mean vs Stability View四种视图。通过实例展示了数据处理、图形绘制及结果解读,强调了数据完整性和格式的重要性,并与GenStat进行了对比分析。
摘要由CSDN通过智能技术生成

怎么用R语言做GGE Biplot双标图(how to)主要结论:

基本可以做出GGE Biplot双标图,颜色有点丑。

在数据没有缺失值的情况下,可以分析,但是如果有缺失值,就不能分析,对数据格式要求较为严格。

如果数据中有缺失值,建议用GenStat分析。

下面的例子说明R语言和GenStat针对同样的数据,如何做GGE Biplot双标图。

安装GGEBiplot包,载入包######R package GGEBiplot GUI######

install.packages("GGEBiplotGUI")

library(GGEBiplotGUI)

data(Ontario)

head(Ontario)

str(Ontario)

row.names(Ontario)以上代码是测试软件是否安装成功,是否可以作图双标图。

使用方法:GGEBiplot(data)就可以了。

它的格式比较特别,将yan数据导入后,需要对数据进行操作

然后将gen名换为行号

整理完数据,开始用R中的包和GenStat进行比较。

1、Which-Won-Where View,就是哪个品种哪个环境中是最好的

对应GenStat模型:

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