怎么用R语言做GGE Biplot双标图(how to)主要结论:
基本可以做出GGE Biplot双标图,颜色有点丑。
在数据没有缺失值的情况下,可以分析,但是如果有缺失值,就不能分析,对数据格式要求较为严格。
如果数据中有缺失值,建议用GenStat分析。
下面的例子说明R语言和GenStat针对同样的数据,如何做GGE Biplot双标图。
安装GGEBiplot包,载入包######R package GGEBiplot GUI######
install.packages("GGEBiplotGUI")
library(GGEBiplotGUI)
data(Ontario)
head(Ontario)
str(Ontario)
row.names(Ontario)以上代码是测试软件是否安装成功,是否可以作图双标图。
使用方法:GGEBiplot(data)就可以了。
它的格式比较特别,将yan数据导入后,需要对数据进行操作
然后将gen名换为行号
整理完数据,开始用R中的包和GenStat进行比较。
1、Which-Won-Where View,就是哪个品种哪个环境中是最好的
对应GenStat模型: