ef1a启动子_启动子的选择和预测

启动子是位于结构基因5'端上游的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特性。常规启动子以二型为主，核心序列包含TATA box和CAAT box，这两部分组成的序列含有基础转录活性，也就是具备启动子特征，但是表达水平很低，此序列紧挨着转录起始位点TSS，一般位于编码基因5UTR(不是ATG哦)上游的300bp之内。

研究启动子，其实不是研究核心启动子，而是研究启动子在细胞不同状态下表达活性的差异性，这种差异由启动子临近基序调控，研究较多的是增强子、甲基化、转录因子，这些基序位于核心启动子上游居多，所以，常规取包含核心启动子及其上游共计2kb进行研究。

根据启动子的转录模式可以将其分为 3 类：组成型启动子、组织或器官特异性启动子和诱导型启动子。

组成型启动子所启动基因的表达具有持续性，亦称之为非特异性表达启动子。如果对基因表达没有时空性的要求，通常都选择此类启动子。 哺乳动物中常用的组成型启动子有 UbC、EF1a、SV40、PGK、CAG 等等。 组织特异性启动子是指在该启动子调控下，外源基因的表达一般只发生在某些特定来源的细胞或组织部位(下表)。

其中肿瘤特异性启动子在基因治疗方面应用较广，用来调控治疗基因在恶性细胞中的特异性表达(下表)。治疗基因被限制于恶性细胞，这样就能避免非特异性的细胞 毒性，而不影响周围正常的细胞。

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