TBtools | 多图合一至强版教程！进化树 + Motifs + 结构域 + 启动子 + 基因结构 + ....

放一张效果图，这些，三四年前的东西，我其实一直懒得说。

写在前面

“Gene Structure View (Advanced)”这个功能可以说，也是一时兴起写出来的。开发的主要动机，还是发现师弟师妹在做的事情实在是太费时间精力。就这样，四五年过去了。直到现在，我仍然没搞懂，这个功能是怎么被大伙用起来的。我甚至没有花过时间，专门为这个功能写教程。网络上已有的教程，均是用户们自发总结，确实已经讲解得足够清晰明白。多少，我有时看到还是有点感动，毕竟这些事情也可以说是软件开发的一部分。太懒，仍然是我的问题。工作以后，能静下心来写点文字的时间，越来越少。正是假期，我已然预见明天之后便是忙碌的一个月。为此，享受这最后一天。相对系统的总结一份教程，希望能减少一部分用户使用问题，也让一些朋友能够更好的使用工具。
这份教程，将会首先简单介绍界面组成，随后介绍分块功能（原名是 Amazing Optional Gene View，因为确实灵活），最后介绍全局组合。

功能界面介绍

TBtools 这个子工具的功能，比较稳健和丰富。可以先看看界面的主要组成。

1. 待可视化的基因 ID 列表或者进化树，如果输入的是进化树，那么进化树也是有基因 ID 的，在程序逻辑上，跟 ID 列表区别不大。TBtools 会使用这个基因 ID 列表，自动提取MEME，Domain，尤其是gff3/gtf 文件中的基因结构信息。用于展示。可想而知，这个输入对于 gtf/gff3 文件来说是必须，对于 MEME 等输入非必须。

2. MEME / MAST XML File，对应的是MEME Suite的两个软件输出。从MEME Suite分析Motifs后，自然会得到这两个XML文件。当然，也可以用 TBtools 打包的 MEME/MAST GUI Wrapper，直接在 Windows/MacOS 电脑下本地跑。

3. GFF3/GTF文件 - 基因结构注释信息，此处是 TBtools 最有趣的地方。用户当然可以提供只包含某些基因的文件，比如某个家族的所有成员的基因结构信息。但对于 TBtools 用户来说，准备这个文件，只是画蛇添足。TBtools 直接支持物种基因结构注释信息全集！在