用python做生物信息数据分析_基于Python的自动获取生物信息数据的软件设计

基于

Python

的自动获取生物信息数据的软件设计

*

周斯涵，刘月兰

**

【摘

要】

【摘

要】

从国际生物信息学数据库中采集数据来进行相关领域的分析，

但随着数据库规模不断扩大

,

数据来源种类繁多

,

即便是直接从网页中搜索所需的

数据，仍十分繁琐并且消耗了大量的时间

.

为了解决该类问题，基于

Python

开

发出了一款可自动从云端数据库中获取指定的数据的应用软件，有效地解决了

在巨量生物信息数据中如何准确检索与快速获取的难题

.

【期刊名称】

哈尔滨师范大学自然科学学报

【年

(

卷

),

期】

2017(033)004

【总页数】

5

【关键词】

【关键词】

数据库；生物信息；数据获取；软件设计

【文献来源】

https://www.zhangqiaokeyan.com/academic-journal-cn_natural-science-journal-harbin-

normal-university_thesis/0201249576459.html

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引言

自从美国启动人类基因组计划以来

,

各种生物的基因组的测序工作进展十分迅速

.

目前

,

在美国

GenBank

数据库中的

DNA

序列的数量已经超过

70

亿碱基对

.

足

可预见

,

未来的生物信息数据的增长将更为迅速

.

在人类基因组计划进入后基因组

时代后，生命科学的研究面临着严峻的挑战

.

生物信息学是互联网不断发展以及

各种生物实验数据快速增长的形势下不断发展起来的采集生物学数据

,

并从生物

学数据中获取新知识的一门学科，为了使生物信息学研究者不在浩如烟海的信

息中迷失方向，该文基于

Python

开发出一款可自动从各大数据库中获取指定

条目数据的应用软件，有效地解决了在巨量生物信息数据中如何准确检索与快