tcga数据下载_TCGA数据下载（mRNA）

1. 进入GDC网页

   https://portal.gdc.cancer.gov/

2. 点击Repository

   

3. 点击Cases，选择需要研究的肿瘤样本。以结肠癌为例，主要参数：【Primary Site】:colon; 【Program】:TCGA; 【Program】:TCGA-COAD; 

   

4. 点击Files，选择文件类型。主要参数：【Dta Category】:
   transcriptome profiling; 【Experimental Strategy】:RNA-seq; 【Workflow Type】:HTseq-FPKM; 【Data Format】:txt。

5. 加入你的购物车。

   

6. 进入购物车，下载文件：Manifest、Cart(该文件较大，需要一点时间)、Metadata、Clinical.JSON。

   

7. 好了。