linux如何打开fastq文件内容,超大的文本文件如fasta，fastq文件在windows中如何打开...

其实gedit可以打开fastq文件，只是因为3G文件太大gedit就有点力不从心了，可以写个小程序跑截取部分，这样文件变小就可以用gedit打开，

c语言：

#pragma warning(disable:4996)

#include

#include

int main()

{

int m;

char ch;

FILE *fqout, *fqin;//原文件指针，新文件指针

fqout = fopen("E:\\Administrator\\Source\\repos\\SRR539135_2.fastq","r+");

fqin = fopen("E:\\Administrator\\Source\\repos\\SRR539135_2_copy.fastq","w+");

if (fqout == NULL)

{

perror("open file_out failed!\n");//打开失败提醒

}

if (fqin == NULL)

{

perror("open file_in failed!\n");

}

printf("please input the number of copying lines :\n");

scanf("%d",&m);

m = 4 * m;//复制m行到新文件中，之所以乘4，因为fastq是每4行在一起的，

while (m)

{

while ((ch = fgetc(fqout)) != '\x0a')//复制一行到新文件中,

{

fputc(ch, fqin);

}

fputc(ch, fqin);

m--;

}

fclose(fqin);

fclose(fqout);

return 0;

}

程序粗糙，只是想帮忙，不好意思~~