linux系统fasta程序,fasta格式文件处理大全（一）

最新推荐文章于 2022-05-16 10:25:15 发布
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文章标签： linux系统fasta程序
本文主要介绍了fasta文件格式，包括其用途、文件结构，提供了从NCBI下载fasta序列的示例，并分享了如何统计序列数量及进行格式化操作。通过阅读，读者将能够理解和处理fasta格式的生物序列文件。
摘要由CSDN通过智能技术生成

前面我们介绍了fastq格式文件的处理，大概有20多个案例，掌握了这些案例，后面拿到fastq格式之后就可以根据需求，使用合适的软件工具进行处理了，从这次内容开始，我们将逐渐介绍fasta格式文件的处理。相比于fastq格式，fasta格式处理更加容易。

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1 文件格式介绍

FASTA文件主要用于存储生物的序列文件，例如基因组，基因的核酸序列以及氨基酸等，是最常见的生物序列格式，一般以扩展名fa,fasta,fna等。

>NP_214518.1 hypothetical protein

ATGACGGGTTCTGTTGACCGGCCCGACCAGAATCGCGGTGAGCGATCAATGAAGTCACCAGGGTTGGATTTGGTCAGGCGCACCCTGGACGAAGCTCGTGCTGCTGCCCGCGCGCGCGGACAAGACGCCGGTCGAGGGCGGGTCGCTTCCGTTGCGTCGGGTCGGGTGGCCGGACGGCGACGAAGCTGGTCGGGTCCGGGGCCCGACATTCGTGATCCACAACCGCTGGGTAAGGCCGCTCGTGAGCTGGCAAAGAAACGCGGCTGGTCGGTGCGGGTCGCCGAGGGTATGGTGCTCGGCCAGTGGTCTGCGGTGGTCGGCCACCAGATCGCCGAACATGCACGCCCGACTGCGCTAAACGACGGGGTGTTGAGCGTGATTGCGGAGTCGACGGCGTGGGCGACGCAGTTGAGGATCATGCAGGCCCAGCTTCTGGCCAAGATCGCCG

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