Linux系统MPI library之MPICH的安装及使用

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前言

本文介绍Linux系统MPI library MPICH的安装，为程序本地及HPC并行计算做准备。

一、MPI是什么？

MPI(Message Passing Interface)是一个跨语言的通讯协议，用于编写并行计算机。支持点对点和广播。MPI的目标是高性能，大规模性，和可移植性。使用MPI可以充分利用多台计算机的计算资源，提高计算效率和性能，是高性能计算领域的重要技术之一。MPI在今天仍为高性能计算的主要模型。

MPI的基本原理是通过消息传递来实现进程间的通信。每个进程都有一个唯一的标识符，称为进程号（rank），可以通过MPI_COMM_WORLD中的MPI_Comm_rank函数获取。进程可以通过MPI_Send和MPI_Recv函数来发送和接收消息，这些消息可以是任意类型的数据，包括整数、浮点数、字符、数组等等。

MPI的并行计算模型通常采用Master-Slave模式，其中一个进程作为Master进程，负责分配任务和收集结果，其他进程作为Slave进程，负责执行具体的计算任务。Master进程可以通过MPI_Bcast函数将任务分发给所有的Slave进程，Slave进程可以通过MPI_Recv函数接收任务，并通过MPI_Send函数将计算结果发送给Master进程。

MPI有多种免费的实现方式，包括MPICH和OpenMPI等。
这里介绍MPICH在Linux Ubuntu上的安装及使用。

二、两种安装MPICH的方法

1. 使用apt安装及卸载

使用apt安装MPICH，会自动查找并安装相应的依赖包。

# Debian/Ubuntu系统上安装：
sudo apt install mpich
# 卸载MPICH：
sudo apt-get --purge remove mpich

如果顺利安装，可通过 which mpicc查看安装位置。
如果提示没有安装源，可使用下载源代码编译安装，如下。

2. source code编译安装

2.1 下载代码并安装

下载地址：source code
从官网下载stable release的4.2.0版本源代码，下载地址：https://www.mpich.org/static/downloads/4.2.0/mpich-4.2.0.tar.gz

wget https://www.mpich.org/static/downloads/4.2.0/mpich-4.2.0.tar.gz
tar -zxvf mpich-4.2.0.tar.gz
cd mpich-4.2.0
./configure --prefix=/path/to/mpich-4.2.0
make
make install

2.2 设置环境变量并测试

# 在.bashrc中添加
export PATH=/path/to/mpich-4.2.0/bin:$PATH
source ~/.bashrc
# 查看安装
which mpicc
which mpiexec

测试：

cd /path/to/mpich-4.2.0/examples
mpiexec -n 3 ./cpi

2.3 使用

可以使用mpicc、mpicxx、mpifort编译C、C++、Fortran编写的程序，例如## 对C++程序c++test编译：

mpicxx -o c++test c++test.cpp

在本地机器上运行a.out，使用线程数/核数为：

mpiexec -n <number> ./a.out

在多个节点上运行a.out：

mpiexec -f machinefile -n <number> ./a.out

其中，machinefile格式

host1
host2:2
host3:4 # Random comments
host4:1

‘host1’, ‘host2’, ‘host3’和 ‘host4’ 是节点的 hostnames；
‘:2’, ‘:4’, ‘:1’ 设置每个节点上运行的核数，如果没有设置，默认为’:1’

总结

本文介绍Linux系统MPICH的安装，为HPC并行计算做准备。

参考资料

https://blog.csdn.net/weixin_56273009/article/details/130912324