参考目录
- 官方文档 https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/eddy/UsersGuide/#Correcting_slice-to-volume_movement_with_eddy
- 博主的博客 https://blog.csdn.net/happyhorizion/article/details/79354161
自用版,如有错误请指正。
操作流程
1. dcm转换为nii格式
AP和PA:dcm2nii *.dcm
2. Running topup on the b=0 volumes
fslroi data A2P_b0 0 1 // 生成A2P_b0文件是AP方向的
#fslroi data2 P2A_b0 0 1 // 生成P2A_b0文件是PA方向的
fslmerge -t A2P_P2A_b0 A2P_b0 P2A_b0 //前两个命令将生成一个名为A2P_P2A_B0.nii.gz的文件,其中包含两个b=0卷
printf "0 -1 0 0.0646\n0 1 0 0.0646" > acqparams.txt
//[acqparams.txt的详细解释见](https://fsl.fmrib.ox.ac