下载最新版的go.obo文件

最新推荐文章于 2024-06-18 09:31:25 发布
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官网http://geneontology.org/docs/download-ontology/
看到网页开头列表 Permanent URL下的链接
如http://purl.obolibrary.org/obo/go.obo，右键点击该链接
在这里插入图片描述
选择’链接另存为’，即可下载最新版的go.obo文件

Triangulum
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Gene Ontology Browser:用于查看 Gene Ontology (GO) .obo 文件的浏览器。-开源
07-17
Go Browser 允许您在本地机器上查看基因本体。 您可以在层次结构中上下移动并检查术语。 这是熟悉自己并在 GO 系统中定位自己的好方法。 它是使用 Baby X 工具包构建的，因此除了 xlib 之外没有任何依赖项。 Baby X 现在也已移植到 Windows，因此可以使用 Windows 版本。
生物信息tech-Gene Ontology中如何根据GO号查找对应的生物学描述
qq_26309777的博客
04-15 9116
大家在解析blast2go或者其他GO注释工具返回的结果时，发现有时只有对生物过程的描述或GO号，那么如何查看两者的对应关系呢，我们可以登录GO网站go.obo（下载地址：http://purl.obolibrary.org/obo/go.obo）文件。里面有最全面的goterm和description对应关系的信息。 为了方面查看我把爬出来的部分信息列于table1。完...
探索生物信息学的新边界：obonet - 简易高效的OBO格式解析库
最新发布
gitblog_00086的博客
06-18 322
探索生物信息学的新边界：obonet - 简易高效的OBO格式解析库 项目地址:https://gitcode.com/dhimmel/obonet 在这个数字化的时代，生物信息学领域的数据表示与解析变得尤为重要。obonet 是一款专为Python设计的轻量级库，它使得加载和操作OBO（Ontology Biology Format）格式的本体变得更加便捷和高效。如果你处理过生物学或医学的本体数...
GO注释步骤（含批量）
weixin_58269397的博客
03-31 772
注意：这些文件是制表符分隔的文本文件，千万不要保存为 Excel 格式，以免有后续问题！直接整理 eggNOG-mapper 的结果，输出几个文件，分别满足不同下游分析需要。但是使用EBI的工具时是有的（存在报错）2.Gene Onotoloy注释信息。四个文件的具体信息，截图可看。下面2种方法选一种使用即可。的注释结果中没有GO注释。接下来进行数据整理与画图。3.KEGG 注释信息。4.PFAM 注释信息。1.具体功能描述信息。
用Python将GO数据库中obo文件解析成Pandas的DataFrame
qw213e的博客
02-02 962
利用Python将GO数据库中的obo文件装换成了Pandas的DataFrame，希望能帮到有类似需求的朋友。
OBO文件格式1.2
weixin_30408739的博客
12-12 739
该文件每一行都是一个键值对，基本格式为： 键: 值!注释总体结构： 文件头 !包含若干行总体说明 词条1 ![词条类型]占第一行，后跟若干行说明 词条2 !不同的词条可用于描述同一对象的不同方面 . . . !中间可以有若干空白行 !OBO文件中可以在任意地方插入注释，其注释以'!'开头文件头： format-versi...
「GO富集分析」从原理到实践 ~ 零基础掌握
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abai0410的博客
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写在前面 原本，我并无写这一稿件的想法。主要原因有二： 网络上已有相关资料较多，尽管类似的问题天天仍然有人问 再谈起 GO富集分析，距离上次已是五六年，简单来说，不想谈 如果要找合理解释，那么针对第一点，就是每天仍然有大量新接触生信数据分析的朋友；针对第二点，…在前两天我推的文稿《零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM…》中，评论区答应了下，阅读过5000，那就写一写富集分析。于是，如果不写，总是不对。如果要写，只能现在写。毕竟有些事情，现在不做，以后真的不会做。 基因集功能富
快速下载 | TBtools 软件最新版本与相关数据库文件
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
12-14 1万+
导语前前后后找了不少方法途径，最后还是“通过充值解决问题”。使用奶牛快传来分发 TBtools 软件以及相关数据库，可以确保每个人都快速获得文件，经过国内国外多地多点测试，一般速度可以有 ...
GO analysis with TBtools
qq_42639688的博客
04-27 654
用于富集的基因集 （通过差异分析或聚类等各种方式得到的部分基因）;物种背景文件（物种全部基因的GO注释文件，可以通过物种网站下载注释。获得，详细步骤见额外。可以用于后续GO分析。
go-basis.obo
01-12
go-basic.obo 是一种用于描述基因本体（Gene Ontology，简称GO）的文件格式。GO是一种约定了统一标准的用于描述基因和蛋白质功能的分类系统。这个文件包含了基因本体中的一些基本信息，如基因和蛋白质的功能注释、...
purl.obolibrary.org：用于管理OBO PURL的系统
02-17
OBO网址 该存储库提供了用于管理OBO铸造厂永久URL（PURL）的工具。 像一样，我们使用按目录的Apache配置文件（ .htaccess文件），每个配置文件都使用RedirectMatch指令将PURL请求重定向到其适当的目标。 与w3id.org...
Gene_Ontology(GO)简介与使用介绍
02-28
主要是关于生物信息学方面用到的数据库里面的GO的介绍
obonet:OBO格式的本体→networkx（Python 3）
05-01
可以从路径，URL或打开的文件句柄读取OBO文件。 压缩是从路径的扩展名推断出来的。 请参阅下面的示例用法： import networkx import obonet # Read the taxrank ontology url = '...
obo-dash.github.io:OBO仪表板的开发版本
05-11
"obo-dash.github.io:OBO仪表板的开发版本" 这个标题揭示了项目的核心内容是一个名为“OBO仪表板”的开发版本，它托管在GitHub上，具体的URL为“obo-dash.github.io”。这表明这是一个开源项目，主要功能可能是用于...
分享一个基因功能富集的网站——geneontology
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cytoscape插件下载_cytoscape插件BinGO安装以及GO富集分析和网络可视化
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1.安装cytoscape：BInGO为cytoscape软件的插件，因此要使用BinGO，应先安装cytoscape。cytoscape的安装非常简单，由于cytoscape为java软件，安装之前在自己的电脑中提前安装java 的JDK 安装方法见：https://www.omicsclass.com/article/298之后到cytoscape官网下载最新版本安装就好：http://www...
go语言下载文件
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go文件下载（普通文件和压缩文件）
空山新雨后，天气晚来秋
08-22 6003
目录普通文件下载zip压缩文件下载使用场景：前端发送请求传给后端需要下载的资源id等字段，后端整理数据，形成文件并返回文件，浏览器此时会看到字段下载的文件，与平时在浏览器下载资源看到的效果一致。本文的场景正是项目中所遇到的下载资源对应的yaml。我的项目中所用的框架是马卡龙，其他主流的gin、beego等也都是大同小异，供大家参考，希望带来帮助！效果图如下：路由如下： 处理器及相关逻辑： zip压缩文件下载 路由如下： 处理器逻辑： 上面用到的相关工具方法如下： 需要注意的地方：1、生
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