实验记录 | Strelka2安装

这次的安装比我想象中的要简单，只需要下载并解压即可运行。
但是，我并不明白，在这样一个pipeline中，这个软件发挥着怎样的作用（是在bash代码中直接调用吗？）
因此，我先初步的按照官网的介绍，安装。等到后面在pipeline中使用的时候，再一步步的分析代码。
参考链接：
安装：https://github.com/Illumina/strelka/blob/v2.9.x/docs/userGuide/quickStart.md
使用：https://github.com/Illumina/strelka/blob/v2.9.x/docs/userGuide/README.md
官网：https://github.com/Illumina/strelka

1。 安装

下载安装包。
wget https://github.com/Illumina/strelka/releases/download/v2.9.2/strelka-2.9.2.centos6_x86_64.tar.bz2
解压。
tar xvjf strelka-2.9.2.centos6_x86_64.tar.bz2
直接使用，处理示例数据。
使用bash指令，运行bash文件。
bash strelka-2.9.2.centos6_x86_64/bin/runStrelkaSomaticWorkflowDemo.bash

**** Demo results dir: ./strelkaSomaticDemoAnalysis/results/variants
**** No differences between expected and computed results.
**** Demo/verification successfully completed

(后续的使用的具体细节在作进一步的探讨。)