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R语言
文章平均质量分 84
易易欢欢
这个作者很懒,什么都没留下…
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Shiny-Server的安装和使用教程
文章目录Shiny-Server安装UbuntuRedHat/CentOSshiny-server的启动和停止Shiny-Server管理谁来运行shiny Appshiny App运行所需的R包设置端口号LocationShiny-ServerShiny server 可以在线发布shiny应用程序并让用户可以在线管理自己的shiny应用程序。Shiny Server运行各种不同的shiny程序,Shiny Server can manage R processes running various原创 2021-10-29 10:25:04 · 3088 阅读 · 0 评论 -
R安装XML
R安装XML,不管是windows还是linux,其实都是最好就是下载跟你的R版本对应的包进行安装才行。去到https://cran.r-project.org/web/packages/XML/index.html, 如下图:然后呢,关注一下你的R是哪个版本的,然后要下载对应的版本,从 XML_archive上找到,下载下来,本地安装。另外注意一下,依赖关系那里,就是我打了方框那,需要看看你的系统是否有安装,不然的话,还是要看看其他的教程是怎么安装libxml2的。...原创 2020-08-12 22:01:27 · 2028 阅读 · 0 评论 -
GPL对应的Bioconductor注释包(最全)
GPL对应的Bioconductor注释包(最全)这个是我自己通过代码查找到的GPL对应的bioconductor的注释包,如果是能够找到的话,那么就是这个GPL平台号有应的注释包,如果在这里没有找到的话,那就应该是没有的咯。一个比较简单实用的方法,在这个网页下,直接快捷键 Ctrl + F, 然后输入你的平台号,就可以快速找到你要的注释包名称了。至于我如何得到的这个列表,看最底下的代码。...原创 2019-11-21 16:33:49 · 81934 阅读 · 14 评论 -
org.Hs.eg.db安装
org.Hs.eg.db安装我先把问题解决的办法给出来吧。这个是安装成功了的。1.去http://www.bioconductor.org/packages/release/data/annotation/html/org.Hs.eg.db.html下载安装包但是你要注意自己下载的位置在哪,记住路径。后面安装的时候会用到的。然后直接在你的R里面输入以下的代码,记得额,前面的路径和包名要对...原创 2019-04-11 10:18:34 · 25839 阅读 · 7 评论 -
jupyter安装R
这是选择镜像,选择国内的镜像会让下载安装更快一点,当然,安装R包时网速占了很多一部分原因options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))接下来就是安装下面的这些R包install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon'...原创 2019-04-02 11:01:56 · 1281 阅读 · 0 评论 -
Gene id 转换(四种基因各种id转换方法)
对于这三种方法的使用参数在代码里面写了,你可以看看先把基因集对应的注释包安装了,并且加载出来library(org.Hs.eg.db)#这个是属于注释包,每个基因集可能对应的注释包不一样,要从基因集所在的平台找到对应的注释包,然后从bioconductor获取安装。基因集准备data(geneList, package="DOSE")gene <- names(geneList)...原创 2019-04-17 13:25:44 · 111248 阅读 · 8 评论 -
Error: The client is unauthorized due to authentication failure.解决办法
我在用R的neo4jshell包时,运用查询语句时:出现这样的错误:Error: The client is unauthorized due to authentication failure.其实,处理neo4jshell包可以将R和neo4j连接外,还有RNeo4j、neo4r也可以。但是也可能出现这样的错误提示。这时,需要到neo4j对应的文件:neo4j.conf中修改某些内容:...原创 2019-08-06 13:52:12 · 12581 阅读 · 4 评论 -
R 中merge()函数匹配数据或根据一列或多列来合并两个数据框
写merge()这个函数呢,是因为它可以像excel里面的vlookup的功能,根据信息在某个数据框或矩阵内查找并获取你想要的信息。1 先准备数据集准备authors的数据框 和 authorN 数据框authors <- data.frame( ## I(*) : use character columns of names to get sensible sort order...原创 2019-10-06 16:40:52 · 32986 阅读 · 0 评论