jupyter安装R

这是选择镜像，选择国内的镜像会让下载安装更快一点，当然，安装R包时网速占了很多一部分原因

options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))

接下来就是安装下面的这些R包

install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))

这里的选择只需要任选其一的，我是选择第二个命令来安装IRkernel，然后就顺利通过了。

devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
install.packages('IRkernel')

这是最后一步。

IRkernel::installspec(user = FALSE)

常见问题解决办法

• 某个R包不适用于当前的R version

解决办法：

查看当前R语言的版本：

version

然后，看看能否从bioconducor里面下载安装

source("http://bioconductor.org/biocLite.RR")
biocLite("***")      #包的名称

或者，没有windows/mac/linux的binary文件，可以用源码安装：

install.packages("foobarbaz",type="source")

如果都不是适合，重新下载最新的R版本来安装，同时移除旧版本R（我最后装成功的解决办法就是用的这种办法。

• 移除某个包，或者不存在某个R包

比如出现下面这样的问题

Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) : 
  不存在叫‘digest’这个名字的程辑包

也就说你的digest这个包在lib中还存在或者你没有安装。可以试试安装它。采用

install.packages("digest")

然后如果还会出现这样的问题：

 程序包‘digest’打开成功，MD5和检查也通过
 Warning: 无法将拆除原来安装的程序包‘digest’

那就要考虑移除这些digest包，可以利用内置的搜索功能搜索digest，找到它的位置，然后输入以下命令，移除对应lib中digest包：

remove.packages('digest',lib='C:/Program Files/R/R-3.5.1/library') #这里的路径是指你找到的digest所在的位置
remove.packages('digest') #这个命令会移除系统默认的lib中digest包

之后呢，再重新安装这个digest包

install.packages("digest")

另一种安装方法（第一次我用的时候是成功了的）

在anconda prompt命令行中输入：

conda  install -c -r r-essentials