BingdingDB数据库

最新推荐文章于 2023-06-14 17:28:17 发布
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分类专栏： Database 文章标签： Database BindingDB
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BindingDB是一个公开的，可通过网络访问的测量结合亲和力的数据库，主要关注被认为是药物靶标的蛋白质与类似药物的小分子之间的相互作用。 BindingDB包含1,735,582个结合数据，涉及7,352个蛋白质靶标和770,124个小分子。 

There are 2291 protein-ligand crystal structures with BindingDB affinity measurements for proteins with 100% sequence identity, and 5816 crystal structures allowing proteins to 85% sequence identity.

www.bindingdb.org/bind

 

褚骏逸
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专栏目录
药物亲和力相关数据集BindingDB、DAVIS；药物开源数据库源 TDC库
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用于查询 PubChem 的 PUG REST API 以获取有关化合物信息的脚本。
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03-13 258
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如何根据uniports号,爬取bindingDB的活性实验数据
recher_He1107的博客
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写在开头1.靶点信息数据收集1.1 uniprot生物实验数据收集2.1 PUCHEMchembl 总所周知,科研是基于数据的,数据是基础也同样是目的.但如何全面且详细地回顾和收集世界各地地往期工作就是困扰诸多科研工作的难题.但随着大量公开且庞大数据库的出现,似乎在为我们登上巨人的肩膀铸造了电梯.今天就以个人经验总结了一下如何搭乘这一部电梯.如有不足之处也请大家在评论区补充,感谢~ 本文章全程采用Poly [ADP-ribose] polymerase 1(parp-1)蛋白作为例子进行展示 1.靶点信息数
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