Ubuntu18.04+BLAST环境下安装Swiss-Prot和UniRef（二）

【注：笔记于2019年10月7日记录在OneNote里的，现在把它们迁移到CSDN里。】

（1）安装Swiss-Prot

1.准备安装包

先去uniprot官网下载uniprot_sprot安装包（.fasta格式的）：https://www.uniprot.org/

【注：可以通过wget直接下载在服务器指定的文件夹下】

2.解压上传

下载到本地以后解压，把文件（只要文件夹下面的文件）拷贝到服务器 /usr/local/blast/db目录下

3.安装

打开终端界面，切换到 /usr/local/blast/db 路径下执行如下操作：

makeblastdb  -in uniprot_sprot.fasta  -parse_seqids  -hash_index  -dbtype prot

makeblastdb  -in uniprot_sprot.fasta  -parse_seqids  -hash_index  -dbtype prot

注：需手动输入，没报错就说明安装成功了！！！！！哈哈哈哈哈哈

 

 （2）安装UniRef

1.下载数据库包UniRef50

和Swiss-sprot一样的操作，唯一的区别是在终端执行的命令如下：

makeblastdb  -in ./uniref.fasta  -parse_seqids  -hash_index  -dbtype prot

makeblastdb  -in ./uniref.fasta  -parse_seqids  -hash_index  -dbtype prot