日常科研中经常使用的命令

Linux目录树状结构

1. Windows是磁盘分区，Linux不区分盘符，所有文件都在根目录斜线下面；

2. 根目录显示不同，Linux是一个斜线，而windows是盘符，然后冒号；

3. 分割目录Linux用斜线，Windows是反斜线。

为何做生物信息一定要学习Linux？【高效】

常用的Linux命令

1. 查看当前时间

date

2. 查看日历

cal

 3. 显示已登录的用户列表

who

4. 显示当前用户的用户id及所属用户组的信息

id

 5.显示系统已经运行的时间

uptime

6.显示最近用户登录的记录

last

 7. 清空当前屏幕

clear

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（1）在服务器上从查看图片：需要提前在服务器安装ImageMagick软件，本地安装Xming软件，然后使用display命令显示。

ImageMagick – Convert, Edit, or Compose Digital Imageshttps://imagemagick.org/（2）Xshell自带查看图片显示的功能，属性----->隧道------>转发X11连接到(X)

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 科研中遇到的命令

【1】统计文件夹下特定类型（eg： *.npz ）文件个数

ls *.npz | wc -l

2. 处理tsv文件，提取前50列内容并保存成csv文件输出

cut -f 1-50 data.tsv > extracted_data.csv

3. 查看tsv的列名并保存 

head -n 1 data.tsv | awk -F'\t' '{for(i=1;i<=NF;i++) print "Column "i": "$i}'
> mycolumn.log

4. 查看csv文件的列名，并以逗号拼接输出 

head -n 1 extracted_data.csv | tr '\t' ',' | sed 's/,$//'

5. 压缩文件

tar -czvf CPI-Prediction.tar.gz CPI-Prediction/