fprom预测结果内容_启动子分析预测数据库

Promoter 2.0 Prediction Server

http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/

很早之前的预测启动子在线软件，要求输入的gene序列为FASTA格式，可以在线做

Berkeley Drosophila Genome Group

http://fruitfly.org:9005/seq_tools/promoter.html

果蝇基因组相关信息，利用神经网络预测启动子序列

EPD Eukaryotic Promoter Database

http://epd.vital-it.ch/

比较全的基因启动子数据，并且经过试验验证；同时数据库给出UCSC中gene起始位点的数据下载链接。

真核生物启动子数据库主要收集了真核POL II启动子的相关数据，这些启动子是均是已经被注释的，转录的起始位点也是通过试验验证的。用户可以通过输入核苷酸序列查找到启动子所在的位置。数据库将会为这些启动子提供转录起始点扫描数据，相关数据库的链接和原始文献的介绍。RPD为用户提供了一种独特而有效地查询方法，它通过比较序列提取出有生物学意义的启动子子集。同时它对初学者提供了详细的使用说明。RPD由瑞士生物信息学会支持。

SCOPE

http://genie.dartmouth.edu/scope/

利用计算方法在线预测gene的启动子，可以查看很多个物种，并且给出物种数据信息来源链接

PROMOTERS TERMINATORS

http://molbiol-tools.ca/Promoters.htm

收集了预测细菌启动子、真核生物启动子、转录终止位点的预测工具

Promoters

http://linux1.so