FreeSurfer的安装和使用

• 大脑成像处理包
• 可以和suma（音）结合使用。

15.1 下载

• 比较大，7.2.0版本有4.7GB。
• 官方下载：https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/DownloadAndInstall
  • 方法1：直接点击对应链接下载；
  • 方法2：找到下载链接，然后到命令行里用wget命令下载，比如：
    wget https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/pub/dist/freesurfer/7.2.0/freesurfer-linux-centos6_x86_64-7.2.0.tar.gz
• 这个安装包下载用常规的网络特别慢，十几k/s，所以最后我从服务器上copy了别人下载安装好的，然后添加到环境变量中，就可以用了。

15.2 使用

• 官方的Wiki：https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki

• youtube上的讲解视频集：https://www.youtube.com/watch?v=zeFPx0fMXRQ

• 查看图像：freeview

• 在软件主界面，左上角双击图片（volumn）的名字，可以让它排在top位置。

• 关于ROI labeling的wiki：https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FsTutorial/AnatomicalROIV6.0

• 加载ROI labeling的mask，比如：