手把手实战机器学习系列: 随机森林

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2019-02-08 11:43:58

我们将探索决策树，并且拓展它到随机森林。这种类型的模型，和我们之前见过的线性和逻辑回归不同，他们没有权重但是有很好的可解释性。

概述

 

• 目标: 给出一些数据，选择特征并且决定以什么样的方式分裂数据来做出预测。
• 优点:
• 决策树可以做成分类树和回归树。
• 具有很强的可解释性.
• 仅需很少的数据预处理。
• 缺点:
• 当训练数据少于分类类别的时候表现很差。
• 其他: 一组决策树可以构成随机森林，预测结果也会由所有的决策树所决定。

训练

我们来看上方的决策树样例，它用来决策外面的天气是否可以在外玩耍。数据有三个特征(weather, humiditiy和wind) 和结果 (yes or no).

步骤:

1. 基于每一个特征进行分割(例如. 根据三个特征来判断结果是yes还是no）
2. 计算每个特征分裂时候的损失。一些热门的算法比如使用Gini系数来计算的CART算法，还有使用熵和信息增益来计算的ID3。它们都基本上测量了预测值中的杂质或者无序。详细请见 blog post 一个详尽的信息增益计算步骤。

 

• H(X): 数据集X的熵
• C: 类别集合
• p(c): 在c类别中和所有实例的占比

对于一个二分类任务来说，如果所有的样例在一个类别下都是相同的，那么它的熵值为0，如果仅有一半是正确的，那么它的熵值则为1（也是最差的情况等同于瞎猜）。一旦我们决定了熵值，我们需要计算出信息增益(IG)(比如. 在我们把数据X基于特征F分裂后不确定的样本减少了多少)。

 

• IG(F. X): 数据X基于特征F分裂后的信息增益
• H(X): 数据集X的熵
• T: 基于分裂F后的子集
• p(t): 所有实例中t的实例数的比例
• H(t): 子集t的熵

注意: 对于回归问题，你可以用标准偏差（standard deviation）来取代信息增益。

3.在所有的特征分裂后，信息增益最高的分裂将作为第一个特征的分裂(也就是决策树的根).

4.基于第一次分裂后，重复上述的步骤在余下的所有特征中。最后，我们将分裂到叶子结点，在叶子结点中大部分样本将会来自同一类。

 

数据

加载一些使用的库

from argparse import Namespace //用来解析参数

import matplotlib.pyplot as plt //用来进行可视化

import numpy as np

import pandas as pd

import urllib

设置参数

# 参数
args = Namespace(
 seed=1234,
 data_file="titanic.csv",
 train_size=0.75,
 test_size=0.25,
 num_epochs=100,
 max_depth=4,
 min_samples_leaf=5,
 n_estimators=10, # 随机森林中包含的决策树个数
)
# 设置随即种子来保证实验结果的可重复性。
np.random.seed(args.seed)

使用pandas读取文件

# 把CSV文件内容读到DataFrame中
df = pd.read_csv(args.data_file, header=0)
df.head()

 

from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier

预处理内容

# 预处理
def preprocess(df):
 
 # 删除掉含有空值的行
 df = df.dropna()
 # 删除基于文本的特征 (我们以后的课程将会学习怎么使用它们)
 features_to_drop = ["name", "cabin", "ticket"]
 df = df.drop(features_to_drop, axis=1)
 # pclass, sex, 和 embarked 是类别变量
 # 我们将把字符串转化成浮点数，不再是逻辑回归中的编码变量
 df['sex'] = df['sex'].map( {'female': 0, 'male': 1} ).astype(int)
 df["embarked"] = df['embarked'].dropna().map( {'S':0, 'C':1, 'Q':2} ).astype(int)
 return df

数据预处理结果:

# 数据预处理
df = preprocess(df)
df.head()

 

# 划分数据到训练集和测试集
mask = np.random.rand(len(df)) < args.train_size
train_df = df[mask]
test_df = df[~mask]
print ("Train size: {0}, test size: {1}".format(len(train_df), len(test_df)))

划分训练集和测试集

# 分离 X 和 y
X_train = train_df.drop(["survived"], axis=1)
y_train = train_df["survived"]
X_test = test_df.drop(["survived"], axis=1)
y_test = test_df["survived"]

注意: 你可以随意改动 max_depth 和 min_samples 来观察决策树表现好坏的变化。 我们怎么知道什么时候可以停止分裂？如果我们有一个很多特征的数据集，我们的决策树也会非常大。如果我们一直去分裂，我们终究会导致过拟合。所以这里有一些处理办法可以参考：

• 设置在叶子节点中的最少样本个数。
• 设置一个最大的深度(也就是从树根到叶子节点的最大距离)。
• 通过删除几乎没有信息增益的特征对决策树进行剪枝。

创建模型:

# 初始化模型
dtree = DecisionTreeClassifier(criterion="entropy", random_state=args.seed, 
 max_depth=args.max_depth, 
 min_samples_leaf=args.min_samples_leaf)

训练模型

# 训练

dtree.fit(X_train, y_train)

模型预测

# 预测
pred_train = dtree.predict(X_train)
pred_test = dtree.predict(X_test)

模型评估

from sklearn.metrics import accuracy_score, precision_recall_fscore_support

计算模型的评估指标

# 正确率

train_acc = accuracy_score(y_train, pred_train)

test_acc = accuracy_score(y_test, pred_test)

print ("train acc: {0:.2f}, test acc: {1:.2f}".format(train_acc, test_acc))

train acc: 0.82, test acc: 0.70

# 计算其他的模型评估指标

precision, recall, F1, _ = precision_recall_fscore_support(y_test, pred_test, average="binary")

print ("precision: {0:.2f}. recall: {1:.2f}, F1: {2:.2f}".format(precision, recall, F1))

可解释性

安装必要的包

# 安装必要的包
!apt-get install graphviz
!pip install pydotplus
from sklearn.externals.six import StringIO 
from IPython.display import Image 
from sklearn.tree import export_graphviz
import pydotplus
# 可解释性
dot_data = StringIO()
export_graphviz(dtree, out_file=dot_data, 
 feature_names=list(train_df.drop(['survived'], axis=1)), 
 class_names = ['died', 'survived'],
 rounded = True, filled= True, special_characters=True)
graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue()) 
Image(graph.create_png(), width=500, height=300)

画出特征重要性

# 特征重要性

features = list(X_test.columns)

importances = dtree.feature_importances_

indices = np.argsort(importances)[::-1]

num_features = len(importances)

# 画出树中的特征重要性

plt.figure()

plt.title("Feature importances")

plt.bar(range(num_features), importances[indices], color="g", align="center")

plt.xticks(range(num_features), [features[i] for i in indices], rotation='45')

plt.xlim([-1, num_features])

plt.show()

# 打印值

for i in indices:

print ("{0} - {1:.3f}".format(features[i], importances[i]))

如图所示

 

随机森林

随机森林由一组，或者说一个集成的决策树在一起构建。它的意图是，与单个决策树相比，一组不同的树将产生更准确的预测。 但是如果我们在相同的数据下用相同的分裂条件比如说信息增益，那么怎么保证每棵树又是不同的呢？这里的解决方法是随机森林中的不同决策树由不同的数据子集组成，甚至不同的特征阈值。

 

Scikit-learn 实现

from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier

创建模型

# 初始化随机森林
forest = RandomForestClassifier(
 n_estimators=args.n_estimators, criterion="entropy", 
 max_depth=args.max_depth, min_samples_leaf=args.min_samples_leaf)

训练模型

# 训练
forest.fit(X_train, y_train)

模型预测

# 预测
pred_train = forest.predict(X_train)
pred_test = forest.predict(X_test)

模型评估

# 正确率
train_acc = accuracy_score(y_train, pred_train)
test_acc = accuracy_score(y_test, pred_test)
print ("train acc: {0:.2f}, test acc: {1:.2f}".format(train_acc, test_acc))
# 计算其他评估指标 
precision, recall, F1, _ = precision_recall_fscore_support(y_test, pred_test, average="binary")
print ("precision: {0:.2f}. recall: {1:.2f}, F1: {2:.2f}".format(precision, recall, F1))
train acc: 0.80, test acc: 0.68
precision: 0.65. recall: 0.87, F1: 0.75

可解释性

# 特征重要性
features = list(X_test.columns)
importances = forest.feature_importances_
std = np.std([tree.feature_importances_ for tree in forest.estimators_], axis=0)
indices = np.argsort(importances)[::-1]
num_features = len(importances)
# 画出树中的特征重要性
plt.figure()
plt.title("Feature importances")
plt.bar(range(num_features), importances[indices], yerr=std[indices], 
 color="g", align="center")
plt.xticks(range(num_features), [features[i] for i in indices], rotation='45')
plt.xlim([-1, num_features])
plt.show()
# 打印
for i in indices:
 print ("{0} - {1:.3f}".format(features[i], importances[i]))

 

超参数搜索: 网格搜索

在随机森林中，会有许多不同的超参数(criterion, max_depth, n_estimators)等，那么如何去选择什么样的超参数的值，使得模型的效果达到最好，常见的方法有网格搜索，贝叶斯搜索等，在这里我们调用sklearn的GridSearchCV进行超参数的寻找

1. from sklearn.model_selection import GridSearchCV

2.创建网格参数

# 创建网格的参数

param_grid = {

'bootstrap': [True],

'max_depth': [10, 20, 50],

'max_features': [len(features)],

'min_samples_leaf': [3, 4, 5],

'min_samples_split': [4, 8],

'n_estimators': [5, 10, 50] # of trees

}

3.初始化随机森林

# 初始化随机森林
forest = RandomForestClassifier()

4.实例化网格搜索

# 实例化网格搜索
grid_search = GridSearchCV(estimator=forest, param_grid=param_grid, cv=3, 
 n_jobs=-1, verbose=1)
# 网格搜索拟合数据
grid_search.fit(X_train, y_train)

5.查看最佳参数组合

# 查看最佳参数组合
grid_search.best_params_
# 使用最佳参数训练
best_forest = grid_search.best_estimator_
best_forest.fit(X_train, y_train)

6.模型预测

# 预测
pred_train = best_forest.predict(X_train)
pred_test = best_forest.predict(X_test)

7.计算正确率

# 正确率
train_acc = accuracy_score(y_train, pred_train)
test_acc = accuracy_score(y_test, pred_test)
print ("train acc: {0:.2f}, test acc: {1:.2f}".format(train_acc, test_acc))
# 计算其他评价指标
precision, recall, F1, _ = precision_recall_fscore_support(y_test, pred_test, average="binary")
print ("precision: {0:.2f}. recall: {1:.2f}, F1: {2:.2f}".format(precision, recall, F1))
结果:
train acc: 0.90, test acc: 0.70
precision: 0.70. recall: 0.79, F1: 0.75