【keras】踩坑运行U-Net keras框架实现医学图像分割

参考自：https://blog.csdn.net/u012931582/article/details/70215756

https://github.com/zhixuhao/unet

https://blog.csdn.net/py_yangh/article/details/83003972

文章代码来自：https://blog.csdn.net/awyyauqpmy/article/details/79290710

作者的github：https://github.com/decouples/Unet

1、libtiff 的安装

pip install libtiff 安装失败，只能在官网下载 whl 文件手动安装

安装过程见：https://blog.csdn.net/weixin_42338058/article/details/89883411

2、data 文件路径

尝试了无数次原作者的文件夹结构都不行，只好自己修改文件夹路径

文件夹结构如下：

--aug_label #数据增强后的标签
    --0
      0.tif
    --1
      1.tif
    --2
      2.tif
        .
        .
--aug_merge #数据增强后，增强数据和标签数据在同一张图中，这里应该是伪彩色图
    --0
      0.tif
    --1
      1.tif
    --2
      2.tif
        .
        .
--aug_train #数据增强后，split合并的训练数据和标签
    --0
      0.tif
    --1
      1.tif
   -- 2
      2.tif
        .
        .
--images #训练数据，标签及测试数据所在文件夹路径
   --train
     0.tif
     1.tif
      .
      .
   --test
     0.tif
     1.tif
      .
      .
   --test
     0.tif
     1.tif
      .
      .
--merge
   0.tif
   1.tif
    .
    .
--npydata
   imgs_mask_train.npy
   imgs_test.npy
   imgs_train.npy

3.训练次数

不知道是不是数据量太少，我没用增强后的数据训练，只有30张训练数据，训练10次的acc是0.5左右，20次是0.89的样子，30次是0.69，50次也是0.69，不能增加太多次，未解决该问题~~

 

PS：我的github代码已经修改并跑通，大概89%的准确率，欢迎加星啊~嘻嘻，下面是原图和分割结果

              

https://github.com/peanut1022/2D-U-Net