实验方法获得蛋白质结构的方法有:X射线衍射法,核磁共振法(只能测定质量小于70kDa的蛋白结构)和冷冻电镜,目前已解析的蛋白结构约10万个,仅占所有蛋白的一丢丢,由于实验方法需要的蛋白样品质量高,仪器昂贵且费时,急需一种更高效的方法,于是,计算机预测蛋白结构技术发展起来。蛋白质二级结构单元预测:对于有蛋白结构的序列,可以用DSSP软件展示二级结构原件;对于未知蛋白结构的序列,可以用一些预测软件:
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Fromhttps://www.icourse163.org/learn/SDU-1001907001?tid=1206629207#/learn/announce
三级结构预测:方法有从头计算法、同源建模法、穿线法和综合法。
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如果该序列有相似度30%的蛋白已被解析,那么可以用同源建模方法,常用的是SWISS-MODEL在线服务器,同源建模的原理是相似氨基酸序列对应相似的蛋白结构,如果找不到模板,可以用I-TASSER在线服务器,