三级结构_蛋白生信分析高级篇：三级结构及功能预测

通过前面的学习，对SagA蛋白的同源序列、结构和功能等都有了一定的认识，按耐不住要做实验了吗？ 莫急，我们再深入分析，让论文的内容更丰富、图片更漂亮、预测的功能更精准，吊打那帮不共戴天的审稿人！ 1、三维结构检索PDB 网址： https://www.rcsb.org/ 。这个数据库我们之前也为大家介绍过，可参考 蛋白质结构研究入门，你都知道吗(上)？ ； 来源于两篇35分nature子刊的网站，全面而实用！ ； 怎么查询蛋白质的全部信息-- UniProKB数据库 三维结构图可以用于与其他功能相关蛋白进行三维比较，也能用于后期做分子对接。 三维结构图可以分分钟让文章高大上。

输入蛋白名称，如果有三维结构解析，将看到结果，下载使用即可。此处三维结构已经指明了SagA是一种肽聚糖水解酶。

2、三维结构及功能位点预测 Phyre2： http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index 如果PDB数据库没有收录蛋白三维结构，则可以用Phyre2进行预测。 在检索界面中输入蛋白序列，默认值检索即可。