1. 图里面的字体font family 一致,不管是arial还是helvetica
2. 一个整图里面的x轴的字标 ticks,y轴的字标 ticks 字号一致。ticks原则上最好不要加粗(bold)
3. 图x轴和y轴的title尽量需要比 ticks要大一些,最好是加粗。title与x 轴轴线的距离需要保持一致,不要有的图离得近有的图离得远。另外这个title需要居中。具体方法是用illustrator首先选中其中x 轴线再选中x 轴title,然后再按下x轴线(参照线,不会动),再选择align栏里面的居中就可以按照x轴线居中对齐了。
4.同个figure x 的比如折线图或者箱线图,p的位置最好一致
5.species的复数是species不要去掉s
6.图与图之间不要太过多留白
7.图与图之间对于相同的组分类别需要保持颜色一致,比如男女颜色需要一致,group1和group2也需要一直保持一个颜色,不要figure1一个颜色,figure2一个颜色
8.对于各种涉及到number xxx的x和y轴title,我们为了节省空间,可以替换成N of ...
9.如果有些图的x 和 y 的ticks 太长了,比如化合物1的名字很长,化合物2的名字比较短,我们可以把它分成几行,同时也可以调整行距,可以把这个行距稍微缩短一点,使得这个长的名字别那么突兀
10. 如果我们要在illustrator里面快速的更换颜色,我们可以点击软件里面的取色标记(一个空心的小吸管形象),然后再点击我们想要的颜色,再点击我们想要更改的object,就可以改色成功了。
11. 关于图的四边框或者两边框。有些图是会默认有个黑色边框把图包起来,有些图是就只有左侧边框和下侧边框(一般在ggplot里面是theme_classic生成的),不管是哪一种,我们都应该在所有图里面保持一致。另外还包括图里面的gird,这个理论上如果对结果没有很大帮助,就不要生成了,会使得图比较简洁
12.图框的描边最好保持一致,0.几到1,可以参考具体杂志要求
13.nature系列的杂志要求的页面宽度是183mm的宽度,并不是a4纸的宽度。这个不同人习惯不一样,有些人就是按照这个,有些人是按照a4纸提供,最好让杂志社去调整
14.有些图太浅的话,可以调整下stroke比如化合物的结构图之类的
15.同一张图横着的几个图需要对齐,他们的下缘线x轴那条线需要一个高度
16.pvalue标记不要离 x轴或者y轴太近了,在它外面不要画框框,很奇怪
17.如果同一个小图,比如figure1 d的两个子图拥有一样的legend,其实是完全可以合并的,不然太过冗余
18. x轴标记pca的百分比时候 PCA (21%) pca和括号之间需要留出空格
19. N of xxx , x这里不要大写是小写,但如果是xxx的话,第一个x需要大写
20. 对于pvalue的标记,有时候是*** 有时候我用star⭐️,这样是不对的,我需要用* 符号
21. x,ytitle尽量简洁,可以在legend里面说明
目前是这些随时想起来随时更改。