文章修图遇到的一些问题总结

1. 图里面的字体font family 一致，不管是arial还是helvetica 

2. 一个整图里面的x轴的字标 ticks，y轴的字标 ticks 字号一致。ticks原则上最好不要加粗（bold）

3. 图x轴和y轴的title尽量需要比 ticks要大一些，最好是加粗。title与x 轴轴线的距离需要保持一致，不要有的图离得近有的图离得远。另外这个title需要居中。具体方法是用illustrator首先选中其中x 轴线再选中x 轴title，然后再按下x轴线（参照线，不会动），再选择align栏里面的居中就可以按照x轴线居中对齐了。

4.同个figure x 的比如折线图或者箱线图，p的位置最好一致

5.species的复数是species不要去掉s

6.图与图之间不要太过多留白

7.图与图之间对于相同的组分类别需要保持颜色一致，比如男女颜色需要一致，group1和group2也需要一直保持一个颜色，不要figure1一个颜色，figure2一个颜色

8.对于各种涉及到number xxx的x和y轴title，我们为了节省空间，可以替换成N of ... 

9.如果有些图的x 和 y 的ticks 太长了，比如化合物1的名字很长，化合物2的名字比较短，我们可以把它分成几行，同时也可以调整行距，可以把这个行距稍微缩短一点，使得这个长的名字别那么突兀

10. 如果我们要在illustrator里面快速的更换颜色，我们可以点击软件里面的取色标记（一个空心的小吸管形象），然后再点击我们想要的颜色，再点击我们想要更改的object，就可以改色成功了。

11. 关于图的四边框或者两边框。有些图是会默认有个黑色边框把图包起来，有些图是就只有左侧边框和下侧边框（一般在ggplot里面是theme_classic生成的），不管是哪一种，我们都应该在所有图里面保持一致。另外还包括图里面的gird，这个理论上如果对结果没有很大帮助，就不要生成了，会使得图比较简洁

12.图框的描边最好保持一致，0.几到1，可以参考具体杂志要求

13.nature系列的杂志要求的页面宽度是183mm的宽度，并不是a4纸的宽度。这个不同人习惯不一样，有些人就是按照这个，有些人是按照a4纸提供，最好让杂志社去调整

14.有些图太浅的话，可以调整下stroke比如化合物的结构图之类的

15.同一张图横着的几个图需要对齐，他们的下缘线x轴那条线需要一个高度

16.pvalue标记不要离 x轴或者y轴太近了，在它外面不要画框框，很奇怪

17.如果同一个小图，比如figure1 d的两个子图拥有一样的legend，其实是完全可以合并的，不然太过冗余

18. x轴标记pca的百分比时候 PCA (21%) pca和括号之间需要留出空格

19. N of xxx ， x这里不要大写是小写，但如果是xxx的话，第一个x需要大写

20. 对于pvalue的标记，有时候是*** 有时候我用star⭐️，这样是不对的，我需要用* 符号

21. x，ytitle尽量简洁，可以在legend里面说明

目前是这些随时想起来随时更改。