根据rest/dpasf结果汇报激活脑区【转】

按BA分区总结了脑区功能的文献
http://www.fmriconsulting.com/brodmann/index.html
Bredwiki：
http://neuro.imm.dtu.dk/wiki/Main_Page
Brede Database 输入坐标查脑区：
http://neuro.imm.dtu.dk/services/brededatabase/
各物种脑图：
http://brainmaps.org/index.php?p=datasets-species

图像呈现软件Mango
http://rii.uthscsa.edu/mango/index.html

3D可视化软件：http://brainmaps.org/
BrainmapsB3D
nodes3D

转自http://blog.sina.com.cn/s/blog_4d25466d01017pbv.html

根据rest/dpasf结果汇报激活脑区：
http://restfmri.net/forum/node/1794
http://restfmri.net/forum/sites/default/files/how%20to%20report%20result-2.0.pdf
http://rfmri.org/content/reho-preprocess

例1
Cluster 1
Number of voxels: 38
Peak MNI coordinate: -42 -66 -27
Peak MNI coordinate region: // Left Cerebellum // Cerebellum Posterior Lobe // Declive // undefined // undefined // Cerebelum_Crus1_L (aal)
Peak intensity: -7.0423
#voxels structure
38 --TOTAL # VOXELS–
38 Left Cerebellum
38 Cerebellum Posterior Lobe
30 Cerebelum_Crus1_L (aal)
24 Declive
12 Tuber
5 Cerebelum_6_L (aal)
3 Cerebelum_Crus2_L (aal)
2 Uvula
Peak MNI coordinate region中各个脑区：是峰值坐标从大到小的区域所属，以及BA和AAL分区之类的。
undefined是在该级别的分区中，没有定义该体素。
voxels structure下是指该团块中，有多少体素属于后面描述的结构区域。

问：
有一些cluster很大，并且列出了很多个脑区，我该从这些脑区中怎么做选择？下面附上一个cluster的参数：
Cluster 6
Number of voxels: 1010
Peak MNI coordinate: 9 -69 27
Peak MNI coordinate region: // Right Cerebrum // Occipital Lobe // Precuneus // White Matter // undefined // Cuneus_R (aal)
Peak intensity: 9.248
#voxels structure
1010 --TOTAL # VOXELS–
536 Right Cerebrum
427 Gray Matter
365 Left Cerebrum
351 Precuneus
310 Occipital Lobe
304 Parietal Lobe
277 White Matter
273 Limbic Lobe
230 Precuneus_R (aal)
188 Cingulate Gyrus
185 Cuneus
169 Precuneus_L (aal)
155 brodmann area 31
143 Calcarine_R (aal)
129 brodmann area 7
117 Calcarine_L (aal)
109 Inter-Hemispheric
92 Posterior Cingulate
57 Cingulum_Mid_R (aal)
53 Cuneus_L (aal)
53 Cingulum_Post_L (aal)
50 Cingulum_Mid_L (aal)
47 brodmann area 23
回复：
首先，看Peak的坐标: 9 -69 27，其所在的脑区是Precuneus或者说Cuneus_R (aal)，结果中必须给出。
其次，看有voxel数量最多的有意义的脑区，左右脑，灰质白质，某个脑叶，如果不是特殊研究，一般不说，这里voxel数量最大的是Precuneus。
基于以上两点，Precuneus应该是这个团块的主要脑区。
另外，如果你对某个脑区非常关注，也可以在结果中给出，比如对后扣带感兴趣，根据文章的需要也可以讨论，但并不是结果的主要脑区。

例：
激活脑区 BA 像素 坐标 峰值
Inferior Frontal Gyrus L \ Medial Frontal Gyrus L 11 12 （-9，27，-18） 4.6705
问：
Inferior Frontal Gyrus L和Medial Frontal Gyrus都不在AAL90个脑区内，是可以这样表示吗？老师您建议怎样统计比较好？
回复：
只报告11个体素是不对的，这样，读者会误认为这个cluster的体积只有11个体素。另外，最后的报告中，我建议体积用立方毫米，而不用体素数目，因为不同的研究中，体素的大小可能是不同的。

问：
根据生成的report，具体选择哪个脑区有没有什么参考的标准？我是依据体素从大到小选择一个觉得比较有讨论意义的脑区来统计的。
Cluster 4
Number of voxels: 118
Peak MNI coordinate: -9 27 -18
Peak MNI coordinate region: // Left Cerebrum // Frontal Lobe // Medial Frontal Gyrus // White Matter // undefined // Rectus_L (aal)
Peak intensity: 4.6705
#voxels structure
118 --TOTAL # VOXELS–
115 Left Cerebrum
114 Frontal Lobe
61 White Matter
46 Gray Matter
43 Inferior Frontal Gyrus
43 Rectus_L (aal)
30 Frontal_Inf_Orb_L (aal)
28 Medial Frontal Gyrus
22 brodmann area 11
回复：
peak点坐标在 Rectus，应该报 Rectus或者orbitofrontal cortex。经常会遇到一个cluster延伸到几个脑区，这样，我建议报告 Rectus, extending to…（加上延伸到的脑区）。

问：
alphasim校正的clusters是12个达到p<0.05的水平，报一个cluster一共有20个 voxel，peak点在ACC，但是在这列结果中ACC只占11个voxel，那我是报11个体素吗？这样不就低于校正水平了吗？还是我报这整个 cluster的体素数
回复：
报20个voxel，说peak在ACC。

ReHo、ALFF报告的文件夹：
For ALFF_FunImgARCWS, use zALFF* under Results.
For ReHo_FunImgARCWF, use szReHo* under ResultsS.