学习笔记2021

总的来说，做完DPABISurf，就会生成一堆文件夹，
然后开始做统计。
做统计需要选择ResultsS下的文件，S是平滑，这样更容易出结果，smooth kernel是[6 6 6]。

选择ResutlsS -》 AnatSurfLH -》Thickness -》 fsaverage下的XXthickness.gii文件，进行皮层厚度的对比。
AnatSurf是结构像皮层，fsaverage是结构像皮层空间的标准坐标，而功能空间就需要fsaverage5这个标准坐标。

也可以选择ResultsS -》 FunSurfLH -》RehoXXglobalXX下的szreho文件进行功能像皮层空间的reho值对比。或者选择FunVolume里的szreho，就是体空间对比，也就是前面DPABISF做的。

如果要做皮层下的对比，比如杏仁核啊，海马啊之类的：

选择Resutls —》AnatVolum —》Anat_Segment_Volume.tsv文件，里面会有皮层下的各个核团的体积。

如果要做时间序列，就用：

Resutls的ROISignals下面的ROISignals。去对比。

可以看出：
1、做皮层厚度、皮层空间和体空间的FC,reho等等时，使用的是smooth以后的图像来进行统计，这样减少异常值的影响，也容易出结果。
2、而对于时间序列和皮层下核团，则不能平滑，所以使用Resutls里的结果。
原因：对于时间序列，定义的ROI是取的体素里的平均时间序列，如果对这个ROI平滑，周围2个ROI就会融入进来，成为1个ROI，那这个ROI的坐标就错误了，计算出来的结果其实不是这个ROI的，所以这个不能平滑很容易理解。对于皮层下核团，当然啦，ResultsS文件夹里也没有皮层下核团，所以这个不会记错。不过简单解释下，就是平滑是在吹起来的气球表面做的，而皮层下是结构像里直接分割的，因为也没办法去平滑。