Brain Tumor Segmentation from Multi Modal MR images using Fully Convolutional Neural Network

文章作者:Varghese Alex, Mohammed Safwan, and Ganapathy Krishnamurthi
摘要:这篇文章不仅对脑肿瘤进行了分割,还对病情进行了分析。分割采用一个23 layer的深度FCNN,利用2—D slices作为训练。有130个病人作为训练集,30个作为验证集。
1.处理流程
处理流程
2.数据集
包含了T1、T2、FLAIR、T2 Post四个模态的数据。
3.网络结构
网络结构
4.数据处理
数据进行了Z—SCORE处理,从四个模态选取了7000个训练切片,3000个验证切片。其中7000个切片需要满足,每个切片内都至少包含一个病灶点。(原文:The data imbalance in the dataset was addressed by training the network on slices that comprise of at least one voxel of lesion.)

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