数据预处理--医学图像归一化

1.读取nii格式的医学图像，更改内部的矩阵，重新保存成nii数据；

Nifti数据本身是除了 矩阵信息（也就是图像信息之外），还有和物理坐标相关的 仿射矩阵 以及 Header头文件 信息，但是nibabel的获取数据的方法get_data()是一个单向操作，只可以获取数据，并不能把数据直接存到一个现成的nii文件中，并没有诸如nii_img.data = newdata 这样的方法，意味着不能直接对数据进行更改。
原文链接：https://blog.csdn.net/weixin_40006612/article/details/100893162

'''
	Nibabel
'''
import nibabel as nib
import numpy as np
import glob

test_vol_names =  glob.glob('../data/LPBA40/label1' + '/*.nii')

for i in range(len(test_vol_names)):
    #加载图片
    X = nib.load('../data/LPBA40/label1/S'+ str(i) +'.delineation.structure.label.nii')
   
    
    #把仿射矩阵和头文件都存下来
    affine = X.affine.copy()
    hdr = X.header.copy()
    
    #取数据
    X_data = X.get_data()  
    
    #像素归一化
    X_data=(X_data-np.min(X_data))/(np.m