采用igraph包分析网络数据

最新推荐文章于 2024-06-06 16:16:04 发布
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本文介绍了如何使用R中的igraph包来处理网络数据，包括从文件创建network、网络的可视化、统计拓扑属性以及进行聚类分析。通过示例展示了节点和边的属性处理、布局算法的选择以及社区检测等功能。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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对于网络的可视化和数据挖掘，有很多图形界面的软件可供选择，比如cytoscape, gephi 等等，这些软件使用方便，操作简单，功能的强大，但是同时也有着一个缺点，就是无法自动处理，只能通过人工点击鼠标来操作，对于大批量数据的分析而言，依靠人工费事费力。

为了能够自动化编程处理，有很多的程序被开发出来，专门用于网络数据的可视化和分析，igraph就是其中的佼佼者。igraph是一个开源项目，旨在提供一个简单易用，功能强大的网络数据处理框架，在R，Python, C语言中都有具体实现，网址如下

http://igraph.org/

在这里插入图片描述

本篇以R语言为例，展示其用法。在R语言中，对应的包名为igraph, 安装方式如下

install.packages("igraph")

network对应的数据结构为graph, 通常用大写字母G表示，顶点的英文为vertex, 用大写字母V表示，边的英文为edge, 用大写字母E表示。对于igraph而言，常用的操作

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专栏目录
【R语言实例】igraph — 网络分析与可视化包（1）
wong2016的博客
05-18 9939
作者简介：本文作者系大学统计学专业教师，多年从事统计学的教学科研工作，在随机过程、统计推断、机器学习领域有深厚的理论积累与应用实践。 igraph是一套用于网络分析与可视化的r包，它以高效、便捷、使用简单的特点在网络分析研究中广泛采用。igraph可以在R环境下免费下载安装，目前也有Python实现的igraph. 本文将介绍如何使用igraph包进行基础的网络分析与可视化。 1. igraph 网络 首先，清除R环境里的所有对象后，加载igraph包。 # Remove all the objects.
igraph 算网络指标_网络科学入门：9大技巧带你上手网络数据分析
weixin_39583751的博客
12-01 1288
导语针对复杂网络的分析方法琳琅满目，然而对于网络科学初学者，或者涉及网络的跨学科研究者而言，要快速理解大量相关概念和方法颇有困难。在发表于arxiv.org的一篇预印本论文中，作者以生物学中的各类为例，提供了9个入门网络数据分析的技巧，帮助初学者避免常见的陷阱。从分子到生态系统层面，生物系统通常可以被表示成一系列相互作用的实体。近期在数据采集技术上(例如：高通量的检测和记录)取得的大量进...
iGraph——图挖掘助力社会网络分析
燃烧吧，小肥肉！
10-23 4208
社交网络（如Facebook，Twitter）可以完整地表现人们的生活。人们用不同的方式与他人互动，并且这些信息都可以在社交网络中抓取到。挖掘某个站点的有用信息可以帮助一些团体增加竞争力。 我最近无意中发现一款叫做“iGraph”的工具，它提供了一些非常有效的挖掘功能。以下列举几条我觉得有意思的： 创建图表 图表由节点和连线组成，两者都可以附上一系列属性值（键/值对）。此外，连线
IGraph使用实例——图属性设置2之GML或GraphML输出
octdream的专栏
06-06 876
Graph Modeling Language (GML) 是一种用于描述图形结构的文本格式，它提供了为节点和边分配属性的灵活性.GraphML是一种用于表示图形结构的XML格式，它特别适用于描述节点（或顶点）和边（或链接）之间的关系，以及这些元素上的属性.
Python利用igraph绘制复杂网络聚类（社区检测）结果图
liuhuan323的博客
12-30 2万+
利用Python的igraph包绘制复杂网络的社区检测图。
igraph的layout布局
clancy_wu的博客
05-07 1679
一共有上述9种布局。第一种（dh）：可以显示出社区与社区间的关系，缺点是社区多了有点分不清。第二种（drl）：不推荐使用第三种（fr）：我比较喜欢的一个布局，可以看清有多少社区。推荐第四种（gem）：不推荐使用第五种（graphopt）：我比较喜欢的一个布局，大的社区放在中间。推荐第六种（kk）：也还不错，可以作为补充选择。第七种（lgl）：不推荐使用，太凌乱第八种（mds）：是个不错的布局，值得推荐，是根据距离缩放来的，可以看得清社区间的联系。
r语言数据分析案例.docx
最新发布
07-09
- **社交网络分析：** 运用`igraph`包分析用户之间的关系网络。 **数据可视化：** - **制作图表：** 利用`ggplot2`或`plotly`创建交互式图表，展示热门话题、用户影响力等。 #### 五、金融市场分析案例 **数据...
Network_data_复杂网络仿真_复杂网络数据_复杂网络_
09-29
综上所述，"Network_data_复杂网络仿真_复杂网络数据_复杂网络_"涉及了复杂网络理论、数据集、仿真方法以及分析工具等多个方面，对于深入理解和研究复杂系统具有重要的价值。通过对压缩包中的数据进行分析，我们可以...
igraph_docs.pdf
08-15
- **高效性：**igraph 采用了高效的底层数据结构和算法，能够在大规模网络上快速运行。 - **跨平台性：**支持多种操作系统，包括 Windows、Linux 和 macOS。 - **多语言支持：**除了 C/C++ 之外，还有 Python、R 等...
igraph-layout:CC++ i 图形库扩展以帮助计算顶点的 LGL
06-09
#Igraph CMD 布局# ＃＃安装 运行./configure.sh 运行./build.sh 这应该可以完成工作。 使用二进制igraph-cmd <Input Edge list FIle> <Output> ##Node JS 绑定## 具有节点 js 绑定，以便在节点项目中轻松使用它。 节点模块位于thirdPartyBindings/nodejs var igraph = require ( './thirdPartyBindings/nodejs' ) ; //Test if ll is good. (Can be done once on app load). Just for demo here. igraph . selfTest ( function ( err , passed ) { console
igraph v1.0.0 package
12-22
R topics documented Network Analysis and Visualization，igraph Package version1.0.0
复杂网络聚类方法
11-09
网络簇结构是复杂网络最普遍和最重要的拓扑属性之一,具有同簇节点相互连接密集、异簇节点相互连 接稀疏的特点.揭示网络簇结构的复杂网络聚类方法对分析复杂网络拓扑结构、理解其功能、发现其隐含模式、预 测其行为都具有十分重要的理论意义,在社会网、生物网和万维网中具有广泛应用
R语言的igraph画社交关系图示例
Daisy_chen2015的博客
05-12 8737
R语言中的igraph可以很方便地画出社交关系图。下面是几个示例。 1.最简单的社交关系图 library(igraph) dolphin g jpeg(filename='dolphins.jpg',width=800,height=800,units='px') plot(g, vertex.size=5, layo
常见的六大聚类算法
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诗蕊的专栏
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1. K-Means(K均值)聚类 算法步骤： (1) 首先我们选择一些类/组，并随机初始化它们各自的中心点。中心点是与每个数据点向量长度相同的位置。这需要我们提前预知类的数量(即中心点的数量)。 (2) 计算每个数据点到中心点的距离，数据点距离哪个中心点最近就划分到哪一类中。 (3) 计算每一类中中心点作为新的中心点。 (4) 重复以上步骤，直到每一类中心在每次迭代后变化不大为止。也可...
【R语言实例】igraph — 网络分析与可视化包（2）
wong2016的博客
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作者简介： 本文作者系大学统计学专业教师，多年从事统计学的教学科研工作，在随机过程、统计推 断、机器学习领域有深厚的理论积累与应用实践。 2. 从文件读取网络数据 数据集1： 边列表 边列表数据集由两个文件组成。 Media-Example-NODES.csv Media-Example-EDGES.csv nodes <- read.csv("Dataset1-Media-Example-NODES.csv", header=T, as.is=T) links <- read.csv(.
igraph社团发现和角色提取
建模分析师胡选来
03-03 4512
/********社团发现***********/ 目标：找带权重的社团 选型：networkx社团发现算法很少，igraph算法多，Spark Graphx能找到高效的实现方法。 igraph: 找到社团并提取结果信息 install.packages("igraph") library(igraph) # This is so simple that we will hav
一种新型聚类算法(Clustering by fast search and find of density peaksd)
lvxiong1990的专栏
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作者在这篇文章中介绍了一种新型的聚类算法 -- 基于密度的聚类算法。
igraph study
06-28 347
Igraph | 统计之都 (中国统计学门户网站，免费统计学服务平台) ChenYibo: 社会网络分析：探索人人网好友推荐系统 | 统计之都 (中国统计学门户网站，免费统计学服务平台) RPubs - Natural Language Analysis ...
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