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对于网络的可视化和数据挖掘,有很多图形界面的软件可供选择,比如cytoscape, gephi 等等,这些软件使用方便,操作简单,功能的强大,但是同时也有着一个缺点,就是无法自动处理,只能通过人工点击鼠标来操作,对于大批量数据的分析而言,依靠人工费事费力。
为了能够自动化编程处理,有很多的程序被开发出来,专门用于网络数据的可视化和分析,igraph就是其中的佼佼者。igraph是一个开源项目,旨在提供一个简单易用,功能强大的网络数据处理框架,在R,Python, C语言中都有具体实现,网址如下
本篇以R语言为例,展示其用法。在R语言中,对应的包名为igraph
, 安装方式如下
install.packages("igraph")
network对应的数据结构为graph
, 通常用大写字母G
表示,顶点的英文为vertex
, 用大写字母V
表示,边的英文为edge
, 用大写字母E
表示。对于igraph
而言,常用的操作