PBS作业调度系统的简单命令

最新推荐文章于 2024-04-14 09:46:28 发布
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1.提交作业

qsub 1.pbs

2.查看作业

qstat

3.查看作业情况

qstat <jobId>

4.删除作业

qdel <JOBID>

5.作业编写例子

#!/bin/bash
#PBS -N muscle-fasttree
#PBS -l nodes=1:ppn=24
#PBS -l walltime=7200:00:00
cd  $PBS_O_WORKDIR
小丑尽欢
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Torque（也称为pbs torque）是一种广泛使用的作业调度系统，源于历史悠久的PBS（Portable Batch System），是为本地集群提供资源管理和作业调度的工具。PBS有三个主要分支：OpenPBS、PBS Pro和Torque。OpenPBS是最...
pbs作业系统常用参数以及命令
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07-17 1689
nodecpu=’cat /proc/cpuinfo|grep processor|wc -l’ 反引号内为计算系统可用的cpu核数目，然后赋值给变量nodecpu。强制删除作业（当某些作业由于节点死机无法删除时，可由root用户登录，使用qdel -p 作业号来删除作业）NP=’cat $PBS_NODEFILE|wc -l’ 计算申请的CPU核数量，赋值给NP。nodes=2:ppn=28，即设定该作业所需2个节点，每个节点使用28核。S：作业被服务器挂起，由于一个更优先级的作业需要当前作业的资源。
【科普】集群基础和PBS任务管理常用命令
丑小鸭
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集群基础和PBS任务管理常用命令
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PBS查看历史作业
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PBS查看历史作业PBS默认情况下使用qstat查看作业时是看不到历史作业的，如果需要查询历史作业，需要修改pbs的配置，设置job_history_enable=True，具体命令如下：# qmgr Qmgr: set server job_history_enable=True Qmgr: set server job_history_duration=336:00:00上面的命令设置了保存两周
pbs(torque)技巧
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任务僵死了，要在root下执行qdel -p作业名，才能删除 qdel -p 12345，
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Kanny
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在服务器pbs提交R程序的步骤： 1. 编写Rscript.R文件 2. 在当前.R目录下生成一个.sh文件，如命名为sub.sh，内容如下： #PBS -N jobname #PBS -l nodes=cnode2:ppn=1 cd $PBS_O_WORKDIR R CMD BATCH --no-save Rscript.R （以上jobname为自定义的任务名称，第二行代码指定把任...
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PBS管理系统.pdf
06-26
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