上学的时候都是别人帮忙装好直接用的,现在工作了换了电脑,得自己装了,还是费了点时间,特此记录一下,挽救一下日益衰弱得记忆力。
这次是给自己的家用机安装gromacs,显卡是3060,需要安装cuda来支持显卡加速。
总体安装流程是
1,cmake 3.16.3安装 2,FFTW 3.38安装 3,cuda 11.2安装 4,gromacs 2022.4安装
1,cmake 3.16.3安装
安装gromacs需要cmake3.x才能编译程序,ubuntu 20.04版本似乎自带高版本的cmake,在想起来要装的时候,查看版本就自带了cmake 3.16.3,这一步就省下了。如果需要安装也比较简单。
yyc@C:/var$ cmake -version
cmake version 3.16.3
CMake suite maintained and supported by Kitware (kitware.com/cmake).
2, FFTW 3.38安装
ubuntu 20.04安装FFTW 3.38
sudo apt-get install fftw3 fftw3-dev pkg-config
3,cuda 11.2安装
显卡驱动是510.108.83版本,最高支持11.6版本的cuda,另外有之前的gromacs2021只支持11.3版本一下的cuda,部分数据还需要用到gromacs2021,所以打算安装cuda 11.2。按照以下cuda11.2的安装说明进行安装。
Installation Guide Linux :: CUDA Toolkit Documentation
下载所需的cuda 11.2