wsl子系统ubuntu20.04安装gromacs

本文档详细介绍了如何在Windows Subsystem for Linux (WSL) 的Ubuntu 20.04环境下安装GROMACS分子动力学模拟软件。首先,提供了官方的安装指南链接,接着详细列出了安装cmake的教程,并针对可能出现的openssl版本问题和gcc版本配置进行了指导。此外,还解决了在安装过程中可能遇到的doxygen和graphviz依赖问题,以及fftw3的安装。最后,指导了如何通过cmake配置GROMACS并进行编译、安装,以及将GROMACS的bin目录添加到PATH环境变量中。
摘要由CSDN通过智能技术生成

##安装GMX教程
https://manual.gromacs.org/documentation/current/install-guide/index.html
https://blog.csdn.net/weixin_38412284/article/details/79889283
##安装cmake教程
https://blog.csdn.net/qq_27350133/article/details/121994229
##cmake config失败时,为了安装cmake更新openssl
openssl version -a  ##查看是否安装
apt-get update
apt-get install libssl-dev

###如果因为gcc版本低导致cmake失败,需要重新设置gcc优先版本,删除cmakefiles,重新cmake

##设置gcc版本
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-9 90 --slave /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-9 --slave /usr/bin/gcov gcov /usr/bin/gcov-9

sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-7 70 --slave /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-7 --slave /usr/bin/gcov gcov /usr/bin/gcov-7


###不使用-DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
##make加速
make -j 4 check

##doxygen报错

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