wsl子系统ubuntu20.04安装gromacs

##安装GMX教程
https://manual.gromacs.org/documentation/current/install-guide/index.html
https://blog.csdn.net/weixin_38412284/article/details/79889283
##安装cmake教程
https://blog.csdn.net/qq_27350133/article/details/121994229
##cmake config失败时，为了安装cmake更新openssl
openssl version -a  ##查看是否安装
apt-get update
apt-get install libssl-dev

###如果因为gcc版本低导致cmake失败，需要重新设置gcc优先版本，删除cmakefiles，重新cmake

##设置gcc版本
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-9 90 --slave /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-9 --slave /usr/bin/gcov gcov /usr/bin/gcov-9

sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-7 70 --slave /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-7 --slave /usr/bin/gcov gcov /usr/bin/gcov-7

###不使用-DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
##make加速
make -j 4 check

##doxygen报错
apt-get install doxygen
##还缺失dot
apt-get install graphviz
###cmake失败时，需要清空build文件夹后，重新cmake

##安装fftw3
apt-get install libfftw3-dev

##cmake gmx
cd build
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=OFF -DCMAKE_C_COMPILER=gcc ../

make check -j4  ###可省略
make install
###将/usr/local/gromacs/bin加入PATH
vim ~/.bashrc
i
export PATH="$PATH:/usr/local/gromacs/bin"
esc
:wq
gmx --version