从0开始:500行代码实现 LSM 数据库

前言

LSM-Tree 是很多 NoSQL 数据库引擎的底层实现,例如 LevelDB,Hbase 等。本文基于《数据密集型应用系统设计》中对 LSM-Tree 数据库的设计思路,结合代码实现完整地阐述了一个迷你数据库,核心代码 500 行左右,通过理论结合实践来更好地理解数据库的原理。

一 SSTable(排序字符串表)

之前基于哈希索引实现了一个数据库,它的局限性是哈希表需要整个放入到内存,并且区间查询效率不高。

在哈希索引数据库的日志中,key 的存储顺序就是它的写入顺序,并且对于同一个 key 后出现的 key 优先于之前的 key,因此日志中的 key 顺序并不重要。这样的好处是写入很简单,但没有控制 key 重复带来的问题是浪费了存储空间,初始化加载的耗时会增加。

现在简单地改变一下日志的写入要求:要求写入的 key 有序,并且同一个 key 在一个日志中只能出现一次。这种日志就叫做 SSTable,相比哈希索引的日志有以下优点:

1)合并多个日志文件更加简单高效。

因为日志是有序的,所以可以用文件归并排序算法,即并发读取多个输入文件,比较每个文件的第一个 key,按照顺序拷贝到输出文件。如果有重复的 key,那就只保留最新的日志中的 key 的值,老的丢弃。

2)查询 key 时,不需要在内存中保存所有 key 的索引。

如下图所示,假设需要查找 handiwork,且内存中没有记录该 key 的位置,但因为 SSTable 是有序的,所以我们可以知道 handiwork 如果存在一定是在 handbag 和 handsome 的中间,然后从 handbag 开始扫描日志一直到 handsome 结束。这样的好处是有三个:

  • 内存中只需要记录稀疏索引,减少了内存索引的大小。
  • 查询操作不需要读取整个日志,减少了文件 IO。
  • 可以支持区间查询。

二 构建和维护 SSTable

我们知道写入时 key 会按照任意顺序出现,那么如何保证 SSTable 中的 key 是有序的呢?一个简单方便的方式就是先保存到内存的红黑树中,红黑树是有序的,然后再写入到日志文件里面。

存储引擎的基本工作流程如下:

  • 当写入时,先将其添加到内存的红黑树中,这个内存中的树称为内存表。
  • 当内存表大于某个阈值时,将其作为 SSTable 文件写入到磁盘,因为树是有序的,所以写磁盘的时候直接按顺序写入就行。为了避免内存表未写入文件时数据库崩溃,可以在保存到内存表的同时将数据也写入到另一个日志中(WAL),这样即使数据库崩溃也能从 WAL 中恢复。这个日志写入就类似哈希索引的日志,不需要保证顺序,因为是用来恢复数据的。
  • 处理读请求时,首先尝试在内存表中查找 key,然后从新到旧依次查询 SSTable 日志,直到找到数据或者为空。
  • 后台进程周期性地执行日志合并与压缩过程,丢弃掉已经被覆盖或删除的值。

以上的算法就是 LSM-Tree(基于日志结构的合并树 Log-Structured Merge-Tree) 的实现,基于合并和压缩排序文件原理的存储引擎通常就被称为 LSM 存储引擎,这也是 Hbase、LevelDB 等数据库的底层原理。

三 实现一个基于 LSM 的数据库

前面我们已经知道了 LSM-Tree 的实现算法,在具体实现的时候还有很多设计的问题需要考虑,下面我挑一些关键设计进行分析。

1 内存表存储结构

内存表的 value 存储什么?直接存储原始数据吗?还是存储写命令(包括 set 和 rm )?这是我们面临的第一个设计问题。这里我们先不做判断,先看下一个问题。

内存表达到一定大小之后就要写入到日志文件中持久化。这个过程如果直接禁写处理起来就很简单。但如果要保证内存表在写入文件的同时,还能正常处理读写请求呢?

一个解决思路是:在持久化内存表 A 的同时,可以将当前的内存表指针切换到新的内存表实例 B,此时我们要保证切换之后 A 是只读,只有 B 是可写的,否则我们无法保证内存表 A 持久化的过程是原子操作。

  • get 请求:先查询 B,再查询 A,最后查 SSTable。
  • set 请求:直接写入 A
  • rm 请求:假设 rm 的 key1 只在 A 里面出现了,B 里面没有。这里如果内存表存储的是原始数据,那么 rm 请求是没法处理的,因为 A 是只读的,会导致 rm 失败。如果我们在内存表里面存储的是命令的话,这个问题就是可解的,在 B 里面写入 rm 命令,这样查询 key1 的时候在 B 里面就能查到 key1 已经被删除了。

因此,假设我们持久化内存表时做禁写,那么 value 是可以直接存储原始数据的,但是如果我们希望持久化内存表时不禁写,那么 value 值就必须要存储命令。我们肯定是要追求高性能不禁写的,所以 value 值需要保存的是命令, Hbase 也是这样设计的,背后的原因也是这个。

另外,当内存表已经超过阈值要持久化的时候,发现前一次持久化还没有做完,那么就需要等待前一次持久化完成才能进行本次持久化。换句话说,内存表持久化只能串行进行。

2 SSTable 的文件格式

为了实现高效的文件读取,我们需要好好设计一下文件格式。

以下是我设计的 SSTable 日志格式:

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