R中安装Seurat遇到的问题：R session aborted

最新推荐文章于 2024-12-03 15:53:09 发布

水瓶之翼

最新推荐文章于 2024-12-03 15:53:09 发布

阅读量3.3k

点赞数 1

文章标签：程序人生

本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_44655777/article/details/128738288

版权

在尝试在R 4.2.2环境中安装Seurat时遇到'R session aborted'错误。问题可能源于从R 4.1.0迁移的包。通过在旧电脑上安装Seurat并新电脑上设置干净的R包路径解决了问题。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

R中安装Seurat遇到的问题：R session aborted

今天安装Seurat时遇到了一个问题：

最低0.47元/天解锁文章

确定要放弃本次机会？

福利倒计时

: :

立减 ¥

普通VIP年卡可用

立即使用

水瓶之翼

关注关注

1
点赞
踩
1

收藏

觉得还不错? 一键收藏
4
评论
分享

复制链接

分享到 QQ

分享到新浪微博

扫一扫
举报

举报

裸服务器R安装不上Seurat包

lqyworldtour的博客

04-24

715

不管直接install,还是BiocManager都安装不上，每次都会这样报错。但是无论如何都是安装不上，报错都是一样的。并且我已经升级了g++(GCC)

在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat2 和 Seurat3的教程

09-14

在Linux环境中，使用相同版本的R安装Seurat2和Seurat3可能对某些研究项目至关重要，特别是当两个版本的Seurat各有优势时。Seurat是一款强大的R包，专用于单细胞分析，包含了多种分析工具，如细胞过滤、tSNE和UMAP...

4 条评论您还未登录，请先登录后发表或查看评论

[已解决] Rstudio出现炸弹 R Session Aborted

qq_30632567的博客

07-30

4663

因为打开了一个过大文件，导致Rstudio环境损坏。

R语言报错：在加载Rdata文件中产生“R session aborted”的报错

Yuuuuuan_的博客

07-15

1037

原因：由于生成Rdata文件时的R版本与当前的版本不同，其格式不再与当前R环境兼容，导致加载失败并中止R会话。解决方案：使用当前R版本重新生成Rdata文件即可解决。

解决Seurat包使用RunUAMP时候R session Aborted的问题

MedPro

06-06

273

【代码】解决Seurat包使用RunUAMP时候R Recession Aborted的问题。

RStudio错误提示：“R session had a fatal error”

热门推荐

goldendata的博客

11-07

1万+

如题，之前一直可以正常使用RStudio，最近一段时间比较忙，没有用RStudio，再次打开时，就提示“R session had a fatal error”，这是为什么呢？下面的解决方法好像都不管用： ① 电脑可能安装了多个版本的R，把其他的卸载掉，保留一个版本的R就行了。————我试了的，不管用。以前我也是两个版本的R同时存在，但RStudio正常使用。 ② 你的R和RStu

R中安装“Seurat”报错

焦解糖的博客

07-04

1482

报错过程中忘记截图，就用了参考推文中的图片，报错内容是一一致的。安装成功后，将下载好的。

「Debug R」一个Seurat导致的Rstudio网页版经常被终止的bug

xuzhougeng blog

05-02

1701

在网页版的Rstuio加载Seurat时，等待了很久都没有成功，刷新网页后就出现了如下的提示

Interactive-3D-Plotting-in-Seurat-3.0.0:该存储库包含R代码，您可以使用该代码创建Seurat分析的scRNAseq数据的3D UMAP和tSNE图

05-13

V1适用于Seurat v2.3.4 + v3.0.2，而V2（更好的交互式图形，使用RShiny）的代码适用于Seurat v3.0.0-v3.1.1 该代码背后的引擎使用了plotly：Plotly Technologies Inc.协作数据科学。蒙特利尔，QC，2015.https 。...

scrna_seurat_pipeline:单细胞转录组学数据的全面分析

04-12

packages_install.R是一个简单的脚本，可让您安装所需的所有软件包。即在目录中的文件是使用由data_factory.R产生的数据可视化。其中一些是从模板文件生成的同时， code_generator.py可以根据config.R生成一些R...

mac R3.6.3安装Seurat出现问题总结

qq_45759229的博客

11-03

464

mac R3.6.3安装Seurat出现问题总结

SeuratData包加载内置dataset失败解决方法

m0_57279973的博客

11-14

505

正确的安装代码是。

Fatal error: Could not find device (or device not supported) Session aborted!解决方法

YoungJoker的博客

04-19

7303

@Fatal error: Could not find device (or device not supported) Session aborted!解决方法Fatal error: Could not find device (or device not supported) Session aborted!解决方法遇到的问题. 我遇到的问题是：使用IAR下载程序时出现Fatal error: Could not find device (or device not supported) Sess

debug|无法安装seurat v5,可以试试这个方法

最新发布

Rita_rr的博客

12-03

321

所以不能直接 install.package()可能是因为你之前下载的包和现在下载的包有冲突。（需要按照提示将一些基础包放回原来的地方）然后在RGui里运行上面的命令。（把包移出来后可能会报错）可以用下面的代码试试。

R session Aborted 跑贝叶斯的时候出现遇到致命错误，终止会话

m0_56309535的博客

07-28

400

尝试更新R,Rstudio，Rcpp包均无反应，有没有大佬救救可怜的孩子。

JupyterR内核在Seurat及依赖包安装时，Error: C++17 standard requested but CXX17 is not defined各种报错问题及解决方案

Senoh的博客

04-11

4903

满江红

解决IAR出现Probe not found Session aborted!的问题

daisy.skye的博客

04-18

7776

在工程设置中“Debugger>Setup->Driver”中，将默认选择的“CMSIS DAP”修改为J-Link/J-Trace并勾选右侧的“Run to main”。在开发PY32时，使用的IAR软件，但是download and debug 时出现弹窗报错。在项目project上点击鼠标右键选择options。

R语言实操记录——R包无法安装，报错：Warning in system(cmd) : ‘make‘ not found

qq_45794091的博客

11-27

6220

R语言实操记录——R包无法安装，报错：Warning in system(cmd) : ‘make‘ not found。

Rstudio安装Seurat

10-09

RStudio是一款流行的集成开发环境（IDE），它支持多种语言包括R语言。Seurat是一个专为单细胞RNA测序数据分析设计的R包，用于高质量的单细胞转录组分析。要在RStudio中安装Seurat，你可以按照以下步骤操作： 1. **打开RStudio**：启动RStudio并切换到R Markdown或R Console模式。 2. **加载CRAN镜像**（如果需要）：如果你的R默认连接的是非官方镜像，可以使用`install.packages("remotes")`命令先安装remotes包，然后通过`remotes::install_github("rstudio/remotes")`更新R的包源。 3. **安装Seurat**：直接在R Console中输入命令进行安装： ```r install.packages("Seurat") ``` 如果你需要最新版本的Seurat，可以替换为从GitHub仓库安装： ```r remotes::install_github("satijalab/seurat") ``` 4. **加载Seurat库**：安装完成后，你可以使用`library(Seurat)`来加载Seurat包，开始使用其提供的各种功能。