python使用pygraphdb连接graphdb图数据库

前言

本文主要介绍如何用python操作graphdb，以及相应包pygraphdb的安装和使用

一、GraphDB是什么？

GraphDB 是一个高效、强大的图形数据库， 支持RDF和SPARQL。
通过使用SPARQL语句查询数据。

1. 使用参考链接： https://graphdb.ontotext.com/documentation/free/index.html
2. docker部署graphdb文章链接：https://blog.csdn.net/weixin_44836662/article/details/121216577
3. 注意：由于graphdb版本升级会导致pygraphdb出现bug，所以推荐安装 graphdb-free 9.10.0版本的，pygraphdb在此版本基础上构建，后续pygraphdb会更新去适应最新版本的graphdb。
   

二、使用pygraphdb连接graphdb

1.安装pygraphdb

pip install pygraphdb
注意：2.0.0版本以上不兼容它以下的版本

2. 功能介绍

数据管理

1. 通过执行SPARQL语句就可查询和更新Graph数据库
2. 下载数据并保存
3. 上传数据
4. 删除所有的节点数据

数据库管理

1. 获取现有的repository列表
2. 删除现有的repository
3. 创建一个repository
4. 重启现有的repository
5. 获取现有的repository size

3. 快速上手

import pygraphdb

# 数据库 config
host = '0.0.0.0'
port = '7200'
db_name = 'db_name'
user = 'admin'
password = 'password'

# sparql 语句
sparql = 'PREFIX pub: <http://ontology.ontotext.com/taxonomy/> ' \
    'PREFIX pub-old: <http://ontology.ontotext.com/publishing#> ' \
    'select distinct ?x ?Person  ' \
    'where {?x a pub:Person . ' \
    '?x pub:preferredLabel ?Person . ' \
    '?doc pub-old:containsMention / pub-old:hasInstance ?x .}'

# 连接数据库
db = pygraphdb.connect(host=host, port=port, user=user, password=password, db=db_name)


# 获取 cursor
cur = db.cursor()

# 执行sparql语句，得到结果
result = cur.execute(sparql)
print(result)

# 关闭 cursor
cur.close()

# 关闭数据库
db.close()

4. 使用with连接

# 第一种方式

with pygraph.connect(host, port, user, password, db) as db2:
    # 获取 cursor
    cur2 = db2.cursor()
    # 执行sparql语句，得到结果
    result2 = cur2.execute(sparql)
    cur2.close()
    print(result2)


# 第二种方式

db3 = pygraph.connect(host, port, user, password, db)

# 获取 cursor
with db3.cursor() as cur3:
    # 执行sparql语句，得到结果
    result3 = cur3.execute(sparql)
    print(result3)

db3.close()

5.数据管理

import pygraphdb

host = '0.0.0.0'
port = '7200'
db_name = 'db_name'
user = 'admin'
password = 'password'

db = pygraphdb.connect(host, port, user, password, db_name)

cur = db.cursor()

"""
执行查询语句
"""
r = cur.execute('select * where {?s ?p ?o .} limit 100 ')
print(r)


"""
上传数据
支持上传 RDF OWL格式的文件
"""
r2 = cur.upload_data('./example.owl')
print(r2)


"""
下载数据
支持下载 RDF OWL JSON格式的文件 
"""
r3 = cur.download_data('./download_result.owl')
print(r3)


"""
删除全部节点数据
"""
r4 = cur.delete_all_data()
print(r4)

cur.close()

db.close()

6.数据库管理

import pygraphdb

host = '0.0.0.0'
port = '7200'
user = 'admin'
password = 'password'

db = pygraphdb.connect(host, port, user, password)

manager = db.manage_repository()

"""
创建一个repository
"""
db_name = 'example'
r = manager.create_repository_graphdb_free(db_name)
print(r)

"""
删除一个repository
"""
r2 = manager.delete_repository(db_name)
print(r2)


"""
查询所有的repository列表
"""
r3 = manager.get_repository_list()
print(r3)


"""
重启repository
"""
r4 = manager.restart_repository(db_name)
print(r4)


"""
获取数据库大小
"""
r5 = manager.get_repository_size(db_name)
print(r5)

manager.close()

db.close()