利用BioEdit软件进行短序列序列比对之查看突变位点

该教程详细介绍了如何利用BioEdit软件进行基因突变后的位点查看。首先,从指定网站下载并安装BioEdit。然后,通过打开.sangersequencing结果文件,导入参考序列。在新序列中输入备注和序列类型,粘贴比对序列并运行。接着,选择ClustalW进行多序列比对,调整颜色方案以便清晰地观察到哪个碱基位点发生了突变缺失。
摘要由CSDN通过智能技术生成

该教程主要适用于基因突变后查看突变位点

下载安装包:http://www.mbio.ncsu.edu/bioedit/page2.html,这个站点直接点击Download BioEdit.zip (Full install: ca. 11.9 Mb)下载即可
已知得出:
敲除基因的Sanger sequencing 结果
1、直接打开xx.ab1 文件
直接跳出如下界面(软件已安装的条件下)
在这里插入图片描述
2、导入参考序列
点击sequence,选new sequnce
在这里插入图片描述
3、出现如下界面,在红色框框中输入备注,并选择序列的类型,在蓝色框框中粘贴要比对的序列(参考序列),最后点击绿色框框运行并关闭。
在这里插入图片描述
4、出现以下界面,选中要比对的两条序列,然后点击accessory application,然后选择选项中的ClustalW multiple alignment。
在这里插入图片描述

5、比对完成,选择适合的配色,便能轻松的看到那个碱基位点突变缺失了在这里插入图片描述

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