【论文复现-tmi2022】anaconda3安装openslide模块

复现论文：A Graph-Transformer for Whole Slide

论文链接

安装虚拟环境，安装openslide

conda activate D:\Anaconda3\envs\pytorch
pip install openslide-python

如果运行会报错

import openslide

ModuleNotFoundError: Couldn‘t locate OpenSlide DLL. Did you call os.add_dll_directory

在openslide官网去下载windows二进制文件

openslide官网

解压缩windows二进制文件，放入anaconda3文件夹下任意位置

我的存储路径为：
D:\Anaconda3\openslide-win64-20231011

修改lowlevel.py文件内容

lowlevel.py文件路径为：D:\Anaconda3\envs\pytorch\Lib\site-packages\openslide\lowlevel.py

定义OPENSLIDE_PATH

OPENSLIDE_PATH = r'D:\Anaconda3\openslide-win64-20231011\bin'

其中，具体的数值是上一步解压缩的二进制文件的bin文件夹的绝对路径

在platform.system()=='windows’中加入dll路径

import os
os.add_dll_directory(OPENSLIDE_PATH)

大功告成

openslide教程部分引用自：博客