【linux】singularity、source & sh 区别
source & sh 的区别
问题描述
运行.sh文件时,出现了如下问题
syntax error near unexpected token `(‘
解决方案
# 原来的写法
sh ./myscript.sh
#改为
source ./myscript.sh
参考文章:syntax error near unexpected token `(‘ 异常解决
关于 singularity 的基础操作
问题描述
(没在cointainer内)source 运行 .sh:permission denied
解决方案
先用singularity进入container,再进行下一步操作
(已安装conda下的 LEFse 环境、已完成singularity镜像拉取)
singularity常用操作集合