巧用Singularity, 助力科学计算

繁琐的库依赖...

没有root权限的HPC平台...

没法随意更换操作系统...

没法管控和修改即有库文件设定....

.....

以上都是各位生、化、环、材等专业从事计算模拟工作的小伙伴都能遇到的问题.

以下探讨一种便捷的完全可控的方案, 协助您避开如上各种麻烦.

由于Singularity支持跨平台, 那么, 你在自己的机器上搞完, 再拿到HPC平台, 当然是可以正常使用的呀. 

基于singularity制作东西, 需要root权限; HPC不可能给你root权限, 你自己搞一个虚拟机自己玩呗. 反正支持跨平台呀. 

在你的机器安装Singularity

这东西仅仅支持Linux. 是的, 没看错, 因为开发者就是使用HPC的, 科学计算的HPC没有人闲的蛋疼使用微软来做, 所以这东西仅仅支持Linux理所当然了.

微软用户, 有两个选择:

1. 微软搞一个虚拟机, 安装一个Linux系统, 比如Rocky LInux 8.5, 或者Ubuntu, 你能搞定就行. 
2. 或者, 租用一个云服务器, 内存大一些, 用完就扔掉. 

具体如何安装Linux, 请bing.com搜素找到Official Site, 下载对应的rpm或者deb包就可以了. 

https://github.com/sylabs/singularity