Python优化算法19——混沌精英黏菌优化算法(CESMA)

科研里面优化算法都用的多,尤其是各种动物园里面的智能仿生优化算法,但是目前都是MATLAB的代码多,python几乎没有什么包,这次把优化算法系列的代码都从底层手写开始。

需要看以前的优化算法文章可以参考:Python优化算法_阡之尘埃的博客-CSDN博客


之前写过黏菌优化算法的文章,现在有很多新的黏菌优化算法,都是进行了一些改进。

本次带来的是混沌精英黏菌算法,当然也会和普通的黏菌优化进行对比。

这是文章的摘要:

为进一步提高标准黏菌算法的收敛速度和求解精度,采用Tent 混沌映射丰富种群多样性,同时引入精英反向学习策略扩大搜索范围。最后,将上述改进算法应用于无刷直流电机的速度环PID 参数自整定。通过在不同运行条件下进行MATLAB 仿真以及实验,结果表明:对比传统PID 以及模糊PID,所提方法能够使得控制精度得到显著提高,并且具有响应速度快,抗干扰能力强等优势。

文章和理论看看就行,主要是代码。本文都是python实现。文章和代码文件都在文末有获取方式。


代码实现

导入包

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt 
import seaborn as sns
import warnings
import copy

plt.rcParams ['font.sans-serif'] ='SimHei'               #显示中文
plt.rcParams ['axes.unicode_minus']=False               #显示负号
warnings.filterwarnings('ignore')
plt.rcParams['font.family'] = 'DejaVu Sans'

只给代码不给使用案例就都是钓鱼的。我这里给出代码,也要给使用案例,先采用一些简单的优化算法常用的测试函数。由于都优化算法需要测试函数,我们先都定义好常见的23个函数:

'''F1函数'''
def F1(X):
    Results=np.sum(X**2)
    return Results
 
'''F2函数'''
def F2(X):
    Results=np.sum(np.abs(X))+np.prod(np.abs(X))
    return Results
 
'''F3函数'''
def F3(X):
    dim=X.shape[0]
    Results=0
    for i in range(dim):
        Results=Results+np.sum(X[0:i+1])**2
    return Results
 
'''F4函数'''
def F4(X):
    Results=np.max(np.abs(X))
    return Results
 
'''F5函数'''
def F5(X):
    dim=X.shape[0]
    Results=np.sum(100*(X[1:dim]-(X[0:dim-1]**2))**2+(X[0:dim-1]-1)**2)
    return Results
 
'''F6函数'''
def F6(X):
    Results=np.sum(np.abs(X+0.5)**2)
    return Results
 
'''F7函数'''
def F7(X):
    dim = X.shape[0]
    Temp = np.arange(1,dim+1,1)
    Results=np.sum(Temp*(X**4))+np.random.random()
    return Results
 
'''F8函数'''
def F8(X):
    Results=np.sum(-X*np.sin(np.sqrt(np.abs(X))))
    return Results
 
'''F9函数'''
def F9(X):
    dim=X.shape[0]
    Results=np.sum(X**2-10*np.cos(2*np.pi*X))+10*dim
    return Results
 
'''F10函数'''
def F10(X):
    dim=X.shape[0]
    Results=-20*np.exp(-0.2*np.sqrt(np.sum(X**2)/dim))-np.exp(np.sum(np.cos(2*np.pi*X))/dim)+20+np.exp(1)
    return Results
 
'''F11函数'''
def F11(X):
    dim=X.shape[0]
    Temp=np.arange(1,dim+1,+1)
    Results=np.sum(X**2)/4000-np.prod(np.cos(X/np.sqrt(Temp)))+1
    return Results
 
'''F12函数'''
def Ufun(x,a,k,m):
    Results=k*((x-a)**m)*(x>a)+k*((-x-a)**m)*(x<-a)
    return Results
 
def F12(X):
    dim=X.shape[0]
    Results=(np.pi/dim)*(10*((np.sin(np.pi*(1+(X[0]+1)/4)))**2)+\
             np.sum((((X[0:dim-1]+1)/4)**2)*(1+10*((np.sin(np.pi*(1+X[1:dim]+1)/4)))**2)+((X[dim-1]+1)/4)**2))+\
    np.sum(Ufun(X,10,100,4))
    return Results
 
'''F13函数'''
def Ufun(x,a,k,m):
    Results=k*((x-a)**m)*(x>a)+k*((-x-a)**m)*(x<-a)
    return Results
 
def F13(X):
    dim=X.shape[0]
    Results=0.1*((np.sin(3*np.pi*X[0]))**2+np.sum((X[0:dim-1]-1)**2*(1+(np.sin(3*np.pi*X[1:dim]))**2))+\
                 ((X[dim-1]-1)**2)*(1+(np.sin(2*np.pi*X[dim-1]))**2))+np.sum(Ufun(X,5,100,4))
    return Results
 
'''F14函数'''
def F14(X):
    aS=np.array([[-32,-16,0,16,32,-32,-16,0,16,32,-32,-16,0,16,32,-32,-16,0,16,32,-32,-16,0,16,32],\
                 [-32,-32,-32,-32,-32,-16,-16,-16,-16,-16,0,0,0,0,0,16,16,16,16,16,32,32,32,32,32]])
    bS=np.zeros(25)
    for i in range(25):
        bS[i]=np.sum((X-aS[:,i])**6)
    Temp=np.arange(1,26,1)
    Results=(1/500+np.sum(1/(Temp+bS)))**(-1)
    return Results
 
'''F15函数'''
def F15(X):
    aK=np.array([0.1957,0.1947,0.1735,0.16,0.0844,0.0627,0.0456,0.0342,0.0323,0.0235,0.0246])
    bK=np.array([0.25,0.5,1,2,4,6,8,10,12,14,16])
    bK=1/bK
    Results=np.sum((aK-((X[0]*(bK**2+X[1]*bK))/(bK**2+X[2]*bK+X[3])))**2)
    return Results
 
'''F16函数'''
def F16(X):
    Results=4*(X[0]**2)-2.1*(X[0]**4)+(X[0]**6)/3+X[0]*X[1]-4*(X[1]**2)+4*(X[1]**4)
    return Results
 
'''F17函数'''
def F17(X):
    Results=(X[1]-(X[0]**2)*5.1/(4*(np.pi**2))+(5/np.pi)*X[0]-6)**2+10*(1-1/(8*np.pi))*np.cos(X[0])+10
    return Results
 
'''F18函数'''
def F18(X):
    Results=(1+(X[0]+X[1]+1)**2*(19-14*X[0]+3*(X[0]**2)-14*X[1]+6*X[0]*X[1]+3*X[1]**2))*\
    (30+(2*X[0]-3*X[1])**2*(18-32*X[0]+12*(X[0]**2)+48*X[1]-36*X[0]*X[1]+27*(X[1]**2)))
    return Results
 
'''F19函数'''
def F19(X):
    aH=np.array([[3,10,30],[0.1,10,35],[3,10,30],[0.1,10,35]])
    cH=np.array([1,1.2,3,3.2])
    pH=np.array([[0.3689,0.117,0.2673],[0.4699,0.4387,0.747],[0.1091,0.8732,0.5547],[0.03815,0.5743,0.8828]])
    Results=0
    for i in range(4):
        Results=Results-cH[i]*np.exp(-(np.sum(aH[i,:]*((X-pH[i,:]))**2)))
    return Results
 
'''F20函数'''
def F20(X):
    aH=np.array([[10,3,17,3.5,1.7,8],[0.05,10,17,0.1,8,14],[3,3.5,1.7,10,17,8],[17,8,0.05,10,0.1,14]])
    cH=np.array([1,1.2,3,3.2])
    pH=np.array([[0.1312,0.1696,0.5569,0.0124,0.8283,0.5886],[0.2329,0.4135,0.8307,0.3736,0.1004,0.9991],\
                 [0.2348,0.1415,0.3522,0.2883,0.3047,0.6650],[0.4047,0.8828,0.8732,0.5743,0.1091,0.0381]])
    Results=0
    for i in range(4):
        Results=Results-cH[i]*np.exp(-(np.sum(aH[i,:]*((X-pH[i,:]))**2)))
    return Results
 
'''F21函数'''
def F21(X):
    aSH=np.array([[4,4,4,4],[1,1,1,1],[8,8,8,8],[6,6,6,6],[3,7,3,7],\
                  [2,9,2,9],[5,5,3,3],[8,1,8,1],[6,2,6,2],[7,3.6,7,3.6]])
    cSH=np.array([0.1,0.2,0.2,0.4,0.4,0.6,0.3,0.7,0.5,0.5])
    Results=0
    for i in range(5):
        Results=Results-(np.dot((X-aSH[i,:]),(X-aSH[i,:]).T)+cSH[i])**(-1)
    return Results
 
'''F22函数'''
def F22(X):
    aSH=np.array([[4,4,4,4],[1,1,1,1],[8,8,8,8],[6,6,6,6],[3,7,3,7],\
                  [2,9,2,9],[5,5,3,3],[8,1,8,1],[6,2,6,2],[7,3.6,7,3.6]])
    cSH=np.array([0.1,0.2,0.2,0.4,0.4,0.6,0.3,0.7,0.5,0.5])
    Results=0
    for i in range(7):
        Results=Results-(np.dot((X-aSH[i,:]),(X-aSH[i,:]).T)+cSH[i])**(-1)
    return Results
 
'''F23函数'''
def F23(X):
    aSH=np.array([[4,4,4,4],[1,1,1,1],[8,8,8,8],[6,6,6,6],[3,7,3,7],\
                  [2,9,2,9],[5,5,3,3],[8,1,8,1],[6,2,6,2],[7,3.6,7,3.6]])
    cSH=np.array([0.1,0.2,0.2,0.4,0.4,0.6,0.3,0.7,0.5,0.5])
    Results=0
    for i in range(10):
        Results=Results-(np.dot((X-aSH[i,:]),(X-aSH[i,:]).T)+cSH[i])**(-1)
    return Results

把他们的参数设置都用字典装起来

Funobject = {'F1': F1,'F2': F2,'F3': F3,'F4': F4,'F5': F5,'F6': F6,'F7': F7,'F8': F8,'F9': F9,'F10': F10,
             'F11': F11,'F12': F12,'F13': F13,'F14': F14,'F15': F15,'F16': F16,'F17': F17,
             'F18': F18,'F19': F19,'F20': F20,'F21': F21,'F22': F22,'F23': F23}
Funobject.keys()
 
#维度,搜索区间下界,搜索区间上界,最优值
Fundim={'F1': [30,-100,100],'F2': [30,-10,10],'F3': [30,-100,100],'F4': [30,-10,10],'F5': [30,-30,30],
 'F6': [30,-100,100],'F7': [30,-1.28,1.28],'F8': [30,-500,500],'F9':[30,-5.12,5.12],'F10': [30,-32,32],
 'F11': [30,-600,600],'F12': [30,-50,50],'F13': [30,-50,50],'F14': [2,-65,65],'F15':[4,-5,5],'F16': [2,-5,5],
 'F17':[2,-5,5],'F18': [2,-2,2],'F19': [3,0,1],'F20': [6,0,1],'F21':[4,0,10],'F22': [4,0,10],'F23': [4,0,10]}

Fundim字典里面装的是对应这个函数的 ,维度,搜索区间下界,搜索区间上界。这样写好方便我们去遍历测试所有的函数。


 

混沌精英黏菌优化算法

终于到了算法的主代码阶段了,这里还会给出普通的黏菌优化算法的代码。

import numpy as np
import random
import math
import copy

def initial(pop, dim, ub, lb):
    X = np.zeros([pop, dim])
    x0 = np.random.random()
    a = 0.7
    for i in range(pop):
        for j in range(dim):
            if x0 < a:
                x = x0/a
            else:
                x = (1-x0)/(1-a)
            X[i, j] = x*(ub[j] - lb[j]) + lb[j]
            x0 = x

    return X, lb, ub


'''边界检查函数'''


def BorderCheck(X, ub, lb, pop, dim):
    for i in range(pop):
        for j in range(dim):
            if X[i, j] > ub[j]:
                X[i, j] = ub[j]
            elif X[i, j] < lb[j]:
                X[i, j] = lb[j]
    return X


'''计算适应度函数'''


def CaculateFitness(X, fun):
    pop = X.shape[0]
    fitness = np.zeros([pop, 1])
    for i in range(pop):
        fitness[i] = fun(X[i, :])
    return fitness


'''适应度排序'''


def SortFitness(Fit):
    fitness = np.sort(Fit, axis=0)
    index = np.argsort(Fit, axis=0)
    return fitness, index


'''根据适应度对位置进行排序'''


def SortPosition(X, index):
    Xnew = np.zeros(X.shape)
    for i in range(X.shape[0]):
        Xnew[i, :] = X[index[i], :]
    return Xnew


'''改进黏菌优化算法'''


def CESMA(pop, dim, lb, ub, MaxIter, fun):
    z = 0.03  # 位置更新参数
    X, lb, ub = initial(pop, dim, ub, lb)  # 初始化种群
    fitness = CaculateFitness(X, fun)  # 计算适应度值
    fitness, sortIndex = SortFitness(fitness)  # 对适应度值排序
    X = SortPosition(X, sortIndex)  # 种群排序
    GbestScore = copy.copy(fitness[0])
    GbestPositon = copy.copy(X[0, :])
    Curve = np.zeros([MaxIter, 1])
    W = np.zeros([pop, dim])  # 权重W矩阵
    for t in range(MaxIter):
        worstFitness = fitness[-1]
        bestFitness = fitness[0]
        S = bestFitness-worstFitness + 10E-8  # 当前最优适应度于最差适应度的差值,10E-8为极小值,避免分母为0;
        for i in range(pop):
            if i < pop/2:  # 适应度排前一半的W计算
                W[i, :] = 1+np.random.random([1, dim]) * \
                    np.log10((bestFitness-fitness[i])/(S)+1)
            else:  # 适应度排后一半的W计算
                W[i, :] = 1-np.random.random([1, dim]) * \
                    np.log10((bestFitness-fitness[i])/(S)+1)
        # 惯性因子a,b
        tt = -(t/MaxIter)+1
        if tt != -1 and tt != 1:
            a = math.atanh(tt)
        else:
            a = 1
        b = 1-t/MaxIter
        # 位置更新
        for i in range(pop):
            if np.random.random() < z:
                X[i, :] = (ub.T-lb.T)*np.random.random([1, dim])+lb.T
            else:
                p = np.tanh(abs(fitness[i]-GbestScore))
                vb = 2*a*np.random.random([1, dim])-a
                vc = 2*b*np.random.random([1, dim])-b
                for j in range(dim):
                    r = np.random.random()
                    A = np.random.randint(pop)
                    B = np.random.randint(pop)
                    if r < p:
                        X[i, j] = GbestPositon[j] + \
                            vb[0, j]*(W[i, j]*X[A, j]-X[B, j])
                    else:
                        X[i, j] = vc[0, j]*X[i, j]

        X = BorderCheck(X, ub, lb, pop, dim)  # 边界检测
        fitness = CaculateFitness(X, fun)  # 计算适应度值
        fitness, sortIndex = SortFitness(fitness)  # 对适应度值排序
        X = SortPosition(X, sortIndex)  # 种群排序
        if(fitness[0] <= GbestScore):  # 更新全局最优
            GbestScore = copy.copy(fitness[0])
            GbestPositon = copy.copy(X[0, :])
        # 改进点:精英反向策略
        lbJ = np.min(X,axis=0)
        ubJ = np.max(X,axis=0)
        Temp = np.zeros([1,dim])
        Temp[0,:]=np.random.randn()*(ubJ+lbJ)-GbestPositon
        for j in range(dim):
            if Temp[0,j]>ub[j] or Temp[0,j]<lb[j]:
                Temp[0,j]=np.random.random()*(ubJ[j]-lbJ[j])+lbJ[j]
        fTemp = fun(Temp[0,:])
        if fTemp<GbestScore:
            #print(1)
            GbestScore=fTemp
            GbestPositon = copy.copy(Temp[0,:])
            fitness[0]=fTemp
            X[0,:]=copy.copy(Temp[0,:])
            
        Curve[t] = GbestScore

    return GbestScore, GbestPositon, Curve

普通黏菌优化(SMA):

''' 种群初始化函数 '''
def initial(pop, dim, ub, lb):
    X = np.zeros([pop, dim])
    for i in range(pop):
        for j in range(dim):
            X[i, j] = random.random()*(ub[j] - lb[j]) + lb[j]
    
    return X,lb,ub
            
'''边界检查函数'''
def BorderCheck(X,ub,lb,pop,dim):
    for i in range(pop):
        for j in range(dim):
            if X[i,j]>ub[j]:
                X[i,j] = ub[j]
            elif X[i,j]<lb[j]:
                X[i,j] = lb[j]
    return X
    
    
'''计算适应度函数'''
def CaculateFitness(X,fun):
    pop = X.shape[0]
    fitness = np.zeros([pop, 1])
    for i in range(pop):
        fitness[i] = fun(X[i, :])
    return fitness

'''适应度排序'''
def SortFitness(Fit):
    fitness = np.sort(Fit, axis=0)
    index = np.argsort(Fit, axis=0)
    return fitness,index


'''根据适应度对位置进行排序'''
def SortPosition(X,index):
    Xnew = np.zeros(X.shape)
    for i in range(X.shape[0]):
        Xnew[i,:] = X[index[i],:]
    return Xnew


'''黏菌优化算法'''
def SMA(pop,dim,lb,ub,MaxIter,fun):
    z = 0.03 #位置更新参数
    X,lb,ub = initial(pop, dim, ub, lb) #初始化种群
    fitness = CaculateFitness(X,fun) #计算适应度值
    fitness,sortIndex = SortFitness(fitness) #对适应度值排序
    X = SortPosition(X,sortIndex) #种群排序
    GbestScore = copy.copy(fitness[0])
    GbestPositon = copy.copy(X[0,:])
    Curve = np.zeros([MaxIter,1])
    W = np.zeros([pop,dim]) #权重W矩阵
    for t in range(MaxIter):
        worstFitness = fitness[-1]
        bestFitness = fitness[0]
        S=bestFitness-worstFitness+ 10E-8 #当前最优适应度于最差适应度的差值,10E-8为极小值,避免分母为0;
        for i in range(pop):
            if i<pop/2: #适应度排前一半的W计算
                W[i,:]= 1+np.random.random([1,dim])*np.log10((bestFitness-fitness[i])/(S)+1)
            else:#适应度排后一半的W计算
                W[i,:]= 1-np.random.random([1,dim])*np.log10((bestFitness-fitness[i])/(S)+1)
        #惯性因子a,b
        tt = -(t/MaxIter)+1
        if tt!=-1 and tt!=1:
            a = math.atanh(tt)
        else:
            a = 1
        b = 1-t/MaxIter
        #位置更新
        for i in range(pop):
            if np.random.random()<z:
                X[i,:] = (ub.T-lb.T)*np.random.random([1,dim])+lb.T
            else:
                p = np.tanh(abs(fitness[i]-GbestScore))
                vb = 2*a*np.random.random([1,dim])-a
                vc = 2*b*np.random.random([1,dim])-b
                for j in range(dim):
                    r = np.random.random()
                    A = np.random.randint(pop)
                    B = np.random.randint(pop)
                    if r<p:
                        X[i,j] = GbestPositon[j] + vb[0,j]*(W[i,j]*X[A,j]-X[B,j])
                    else:
                        X[i,j] = vc[0,j]*X[i,j]
        
        X = BorderCheck(X,ub,lb,pop,dim) #边界检测       
        fitness = CaculateFitness(X,fun) #计算适应度值
        fitness,sortIndex = SortFitness(fitness) #对适应度值排序
        X = SortPosition(X,sortIndex) #种群排序
        if(fitness[0]<=GbestScore): #更新全局最优
            GbestScore = copy.copy(fitness[0])
            GbestPositon = copy.copy(X[0,:])
        Curve[t] = GbestScore
    
    return GbestScore,GbestPositon,Curve

其实优化算法差不多都是这个流程,边界函数,适应度函数排序,然后寻优过程等等。

两个算法都放入字典,后面批量化测试。

OPT_algorithms = {'SMA':SMA, 'CESMA':CESMA}
OPT_algorithms.keys()


简单使用

我们选择F11来测试,先看看F11函数三维的情况:

'''F11绘图函数'''
import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D

def F11Plot():
    fig = plt.figure(1) #定义figure
    ax = Axes3D(fig) #将figure变为3d
    x1=np.arange(-600,600,5) #定义x1,范围为[-600,600],间隔为5
    x2=np.arange(-600,600,5) #定义x2,范围为[-600,600],间隔为5
    X1,X2=np.meshgrid(x1,x2) #生成网格
    nSize = x1.shape[0]
    Z=np.zeros([nSize,nSize])
    for i in range(nSize):
        for j in range(nSize):
            X=[X1[i,j],X2[i,j]] #构造F11输入
            X=np.array(X) #将格式由list转换为array
            Z[i,j]=F11(X)  #计算F11的值
    #绘制3D曲面
    # rstride:行之间的跨度  cstride:列之间的跨度
    # rstride:行之间的跨度  cstride:列之间的跨度
    # cmap参数可以控制三维曲面的颜色组合
    ax.plot_surface(X1, X2, Z, rstride = 1, cstride = 1, cmap = plt.get_cmap('rainbow'))
    ax.contour(X1, X2, Z, zdir='z', offset=0)#绘制等高线
    ax.set_xlabel('X1')#x轴说明
    ax.set_ylabel('X2')#y轴说明
    ax.set_zlabel('Z')#z轴说明
    ax.set_title('F11_space')
    plt.show()

F11Plot()

然后我们使用优化算法来寻优,自定义好所有的参数:

#设置参数
pop = 30 #种群数量
MaxIter = 200#最大迭代次数
dim = 30 #维度
lb = -100*np.ones([dim, 1]) #下边界
ub = 100*np.ones([dim, 1])#上边界
#选择适应度函数
fobj = F11
#原始算法
GbestScore,GbestPositon,Curve = CESMA(pop,dim,lb,ub,MaxIter,fobj) 
#改进算法

print('------原始算法结果--------------')
print('最优适应度值:',GbestScore)
print('最优解:',GbestPositon)

其实f11测试函数的最小值是0。所以可以看到这个算法可以寻到最优,效果看起来很不错。

自己使用解决实际问题的时候只需要替换fobj这个目标函数的参数就可以了。

这个函数就如同上面所有的自定义的测试函数一样,你只需要定义输入的x,经过1系列实际问题的计算逻辑,返回的适应度值就可以。


绘制适应度曲线

 

#绘制适应度曲线
plt.figure(figsize=(6,2.7),dpi=128)
plt.semilogy(Curve,'b-',linewidth=2)
plt.xlabel('Iteration',fontsize='medium')
plt.ylabel("Fitness",fontsize='medium')
plt.grid()
plt.title('CESMA',fontsize='large')
plt.legend(['CESMA'], loc='upper right')
plt.show()

我这里是对数轴,但但是也收敛了,在25轮就能收敛。差不多就是最优值了,效果还是很厉害。

其实看到这里差不多就可以去把这个优化算法的函数拿去使用了,演示结束了,但是由于我们这里还需要对它的性能做一些测试,我们会把它在所有的测试函数上都跑一遍,这个时间可能是有点久的。

所有函数都测试一下

准备存储评价结果的数据框

functions = list(Funobject.keys())
algorithms = list(OPT_algorithms.keys())
columns = ['Mean', 'Std', 'Best', 'Worth']
index = pd.MultiIndex.from_product([functions, algorithms], names=['function_name', 'Algorithm_name'])
df_eval = pd.DataFrame(index=index, columns=columns)
df_eval.head()

索引和列名称都建好了,现在就是一个个跑,把值放进去就行了。

准备存储迭代图的数据框

df_Curve=pd.DataFrame(columns=index)
df_Curve

自定义训练函数

#定义训练函数
def train_fun(fobj_name=None,opt_algo_name=None, pop=30,MaxIter=200,Iter=30,show_fit=False):
    fundim=Fundim[fobj_name]  ; fobj=Funobject[fobj_name]
    dim=fundim[0]
    lb = fundim[1]*np.ones([dim, 1]) ; ub = fundim[2]*np.ones([dim, 1])
    
    opt_algo=OPT_algorithms[opt_algo_name]
    
    GbestScore_one=np.zeros([Iter])
    GbestPositon_one=np.zeros([Iter,dim])
    Curve_one=np.zeros([Iter,MaxIter])
    
    for i in range(Iter):
        GbestScore_one[i],GbestPositon_one[i,:],Curve_oneT =opt_algo(pop,dim,lb,ub,MaxIter,fobj)
        Curve_one[i,:]=Curve_oneT.T
    
    oneal_Mean=np.mean(GbestScore_one) #计算平均适应度值
    oneal_Std=np.std(GbestScore_one)#计算标准差
    oneal_Best=np.min(GbestScore_one)#计算最优值
    oneal_Worst=np.max(GbestScore_one)#计算最差值
    
    oneal_MeanCurve=Curve_one.mean(axis=0) #求平均适应度曲线

    #储存结果
    df_eval.loc[(fobj_name, opt_algo_name), :] = [oneal_Mean,oneal_Std, oneal_Best,oneal_Worst]
    df_Curve.loc[:,(fobj_name,opt_algo_name)]=oneal_MeanCurve
    #df_Curve[df_Curve.columns[(fobj_name,opt_algo_name)]] = oneal_MeanCurve
    if show_fit:
        print(f'{fobj_name}函数的{opt_algo_name}算法的平均适应度值是{oneal_Mean},标准差{oneal_Std},最优值{oneal_Best},最差值{oneal_Worst}')

训练测试

#设置参数
pop = 30#种群数量
MaxIter = 100 #代次数
Iter = 30 #运行次数

计算,遍历所有的测试函数

#所有函数,所有算法全部一次性计算
for fobj_name in list(Funobject.keys()):
    for opt_algo_name in OPT_algorithms.keys():
        try:
            train_fun(fobj_name=fobj_name,opt_algo_name=opt_algo_name, pop=pop,MaxIter=MaxIter,Iter=Iter)
            print(f'{fobj_name}的{opt_algo_name}算法完成')
        except Exception as e: # 使用 except 来捕获错误
            print(f'{fobj_name}的{opt_algo_name}算法报错了:{e}') # 打印错误信息

 查看计算出来的评价指标

df_eval

由于这里大部分的测试函数最优值都是零,我们可以看到。两个算法在寻优的最优值情况都是差不多的,其中cesma会比sma的最优值都稍微小一点。所以说两者的效果是差不多的,cesma会稍微好一点点。

同样在f5这个最优值为零的函数上,两者都没有寻到最优,也就是说他可能还是没有跳出局部最优的这种情况。sma有的缺陷,cesma可能还是存在,但是整体而言的话,从最优值的情况下来看,它的效果确实还稍微好一点点,例如f6和f8的最优值都稍微更小了一些。


画出迭代图

评价一个优化算法肯定不能只从最优的情况来看,还要看他训练轮数寻优收敛的时间轮数,来综合评价。

colors = ['darkorange', 'limegreen', 'lightpink', 'deeppink', 'red', 'cornflowerblue', 'grey']
markers = ['^', 'D', 'o', '*', 'X', 'p', 's']

def plot_log_line(df_plot, fobj_name, step=10, save=False):
    plt.figure(figsize=(6, 3), dpi=128)
    for column, color, marker in zip(df_plot.columns, colors, markers):
        plt.semilogy(df_plot.index[::step], df_plot[column][::step].to_numpy(), 
                     color=color, marker=marker, label=column, markersize=4, alpha=0.7)

    plt.xlabel('Iterations')
    plt.ylabel('f')
    plt.legend(loc='best', fontsize=8)
    if save:
        plt.savefig(f'./图片/{fobj_name}不同迭代图.png', bbox_inches='tight')
    plt.show()

# 使用示例
# plot_log_line(your_dataframe, 'example_plot')
for fobj_name in df_Curve.columns.get_level_values(0).unique():
    df1=df_Curve[fobj_name]
    print(f'{fobj_name}的不同算法效果对比:')
    plot_log_line(df1,fobj_name,5,False)   #保存图片-True

注意这里是y轴是对数轴,看起来没那么陡峭。这里可以打印它在每一个测试函数上的迭代图,可以自己具体仔细观察。

这里是把两个算法的迭代曲线图都进行了对比,所有函数都有,这里就不展示太多了,我们从前面两个图来看。可以发现cesma的收敛速度稍微会快一些,我观察了所有的函数,这个收敛速动也是看情况的,但大多数时候来说cesma收敛的一般都是更快的,也就是说这个改进是有效的。


后面还有更多的优化算法,等我有空都写完。其实文章最核心的还是优化算法的函数那一块儿,别的代码都是用来测试它的性能的

当然需要本次案例的全部代码文件的还是可以参考:混沌精英黏菌优化算法,这个算法的文章论文PDF也在。

创作不易,看官觉得写得还不错的话点个关注和赞吧,本人会持续更新python数据分析领域的代码文章~(需要定制类似的代码可私信)

  • 17
    点赞
  • 5
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 打赏
    打赏
  • 0
    评论
python黏菌优化算法是一种基于生物黏菌的行为特点的优化算法黏菌是一种单细胞生物,它通过释放一种粘液来寻找食物和逃离危险。黏菌优化算法模拟了黏菌在寻找最优解的过程,用于解决复杂问题的优化。 该算法的基本思想是通过在问题空间中的随机游走来寻找最优解。首先,随机生成一定数量的解作为黏菌个体,同时初始化它们的粘液浓度。然后,根据解空间中的目标函数计算每个个体的适应度值,并根据适应度值更新粘液浓度。适应度值越高的个体,其粘液浓度越高。 接着,根据当前个体的粘液浓度和周围个体的粘液浓度,确定个体的行为方向。粘液浓度高的个体更有可能吸引并吞噬周围的个体,从而加快搜索的速度。个体通过朝着梯度最大的方向移动,同时更新个体位置和粘液浓度。重复以上步骤,直到满足停止准则。 python黏菌优化算法具有以下优点:首先,算法简单易实现,只需要使用Python编程语言即可。其次,算法灵活性强,适用于各种优化问题。同时,黏菌优化算法对问题空间没有特殊的要求,可以处理连续、离散和混合型的问题。此外,算法具有一定的自适应性,通过个体的粘液浓度来自适应地调整搜索策略。 总的来说,python黏菌优化算法是一种简单而灵活的优化算法,适用于解决各种类型的优化问题。通过模拟黏菌在寻找食物和逃离危险的行为特点,该算法能够高效地搜索解空间并找到最优解。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

阡之尘埃

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值