分享另一个蛋白质数据库——GeneMANIA database

上次分享了几个蛋白质数据库：分享一个蛋白互作网站——String （一）_Lijingxian教你学生信的博客-CSDN博客筛选的差异基因或者想要研究的基因和哪些蛋白有相互作用呢？可以用到很多网站来进行预测，下面我们先讲最火的一个——String database.https://blog.csdn.net/weixin_46500027/article/details/123940137?spm=1001.2014.3001.5501

最近看文章有人用这个数据库，所以特地去操作了一下，下面是引用此数据库对应的文章：

 下面我们进网站看一看：

GeneMANIA这是网址

 该网站主界面如上所示，他还推荐了一个cytoscape app

下面我们要做的就是将基因输入到上面去：

 

 然后选择物种：

点击放大镜按钮，等个几秒钟：

然后就出现网络图了。

 点击左边不同的按钮可以看到不同排布方式的网络图：

 

 

 

右边显示的就是蛋白连接对应的关系。

有的是预测的，有的是共表达的，有的是通路的等等。

 

省略号可以到处图像，导出数据。 

左下角的按钮是对生产网络图的基因进行富集分析。 

我们随便点一个，就会在网络图中用不同的颜色显示富集的基因。

 基本的蛋白互作就是这些。下次讲一讲cytoscape如何画图吧。