2025年了, 都哪些物种有空转数据?

一、写在前面:

之前给大家整理过类似的合集话题:

2022年了,都有哪些器官/组织有scRNA-Seq数据|小鼠篇

2022年了,都有哪些器官/组织有scRNA-Seq数据|人类篇

2023年了, 都哪些物种有scRNA-Seq数据

2024年了, 都哪些组织有空转数据(小鼠篇)

2024年了, 都哪些组织有空转数据(人类篇)


这次我们检索了空间转录组文章中包含除了人类、小鼠数据外的作品,我们尽量在Pubmed里挑了些影响因子较高、时间距今较近的文章列在下表中(包含组织分类、研究方向、DOI、期刊名、当年影像因子、JCR分区、发表年份),精力有限、整理了50篇,欢迎各位前来补充~

空转分析教程可见:

空间转录组学习手册合辑

一文搞定空间转录组与单细胞测序的整合分析

一文搞定单细胞/空间转录组的WGCNA分析

二、文章列表:

分类

具体

DOI

Journal

IF

分区

年份

植物

番茄

DOI:   10.1073/pnas.2310163120

Proc   Natl Acad Sci U S A

9.4

1

2023

拟南芥叶

DOI:   10.1016/j.devcel.2022.04.011

Dev   Cell

10.7

1

2022

花生

DOI:   10.1111/pbi.13884

Plant   Biotechnol J

11.2

1

2022

马齿苋和马蹄苋

DOI:   10.1126/sciadv.abn2349

Sci   Adv

11.7

1

2022

兰花

DOI:   10.1093/nar/gkac773

Nucleic   Acids Res

16.7

1

2022

杨树

DOI:   10.1016/j.molp.2023.03.005

Mol   Plant

17.1

1

2023

大豆根瘤成熟

DOI:   10.1038/s41477-023-01387-z

Nat   Plants

15.8

1

2023

宿主-细菌-真菌相互作用

DOI:   10.1038/s41587-023-01979-2

Nat   Biotechnol

33.1

1

2024

玉米籽粒发育过程

DOI:   10.1038/s41467-023-43006-7

Nat   Commun

14.7

1

2023

杨树初中级生长

DOI:   10.1016/j.xplc.2023.100665

Plant   Commun

9.4

1

2023

石松根进化

DOI:   10.1016/j.cub.2023.08.030

Curr   Biol

8.1

1

2023

水稻

DOI:   10.1016/j.devcel.2024.05.016

Dev   Cell

10.7

1

2024

玉米穗发育

DOI:   10.1038/s41477-024-01683-2

Nat   Plants

15.8

1

2024

菠萝光合作用

DOI:   10.1111/tpj.13630

Plant   J

6.2

1

2017

人参

DOI: 10.1038/srep18283

Sci   Rep

3.8

1

2015

杜鹃花

DOI:   10.3390/genes15111482

Genes   (Basel)

2.8

2

2024

茶树碱

DOI:   10.1186/s13062-023-00377-7

Biol   Direct

5.7

1

2023

水稻

DOI:   10.1111/nph.12577

New   Phytol

8.3

1

2014

拟南芥-灰葡萄孢菌相互作用

DOI: 10.1007/s11033-011-1185-4

Mol   Biol Rep

2.6

3

2012

樱桃

DOI:   10.1111/tpj.15612

Plant   J

6.2

1

2022

玉米茎尖

DOI:   10.1093/plphys/kiab601

Plant   Physiol

6.6

1

2022

发芽大麦粒

DOI:   10.1093/nar/gkad521

Nucleic   Acids Res

16.7

1

2023

百脉根根瘤器官

DOI:   10.1038/s41467-024-50737-8

Nat   Commun

14.7

1

2024

大麦根

DOI:   10.1186/s12864-024-10002-0

BMC   Genomics

3.5

2

2024

竹笋

DOI:   10.1111/nph.20059

New   Phytol

8.3

1

2024

斑马鱼

DOI:   10.1016/j.devcel.2022.04.009

Dev   Cell

10.7

1

2022

大西洋鲑鱼

DOI:   10.1007/s00441-023-03850-x

Cell   Tissue Res

3.2

3

2024

奶牛胎盘

DOI:   10.24272/j.issn.2095-8137.2023.205

Zool   Res

4.0

1

2024

涡虫再生

DOI:   10.1038/s41467-023-39016-0

Nat   Commun

14.7

1

2023

兔颅内血管

DOI:   10.1177/15910199221088691

Interv   Neuroradiol

1.5

3

2022

鸽子

DOI:   10.1371/journal.pgen.1010746

PLoS   Genet

4.0

1

2023

DOI: 10.1152/physiolgenomics.00064.2023

Physiol   Genomics

2.5

2

2023

寄生虫

DOI:   10.1038/s41467-023-42237-y

Nat   Commun

14.7

1

2023

猕猴下丘脑

DOI: 10.1016/j.cmet.2024.01.003

Cell   Metab

27.7

1

2024

家蚕

DOI:   10.1016/j.celrep.2024.114460

Cell   Rep

7.5

1

2024

蜘蛛网

DOI:   10.1126/sciadv.adn0597

Sci   Adv

11.7

1

2024

寄生扁虫

DOI:   10.1038/s41467-024-53215-3

Nat   Commun

14.7

1

2024

果蝇

DOI:   10.1016/j.devcel.2022.04.006

Dev   Cell

10.7

1

2022

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