一、写在前面:
之前给大家整理过类似的合集话题:
2022年了,都有哪些器官/组织有scRNA-Seq数据|小鼠篇
2022年了,都有哪些器官/组织有scRNA-Seq数据|人类篇
这次我们检索了空间转录组文章中包含除了人类、小鼠数据外的作品,我们尽量在Pubmed里挑了些影响因子较高、时间距今较近的文章列在下表中(包含组织分类、研究方向、DOI、期刊名、当年影像因子、JCR分区、发表年份),精力有限、整理了50篇,欢迎各位前来补充~
空转分析教程可见:
二、文章列表:
分类 | 具体 | DOI | Journal | IF | 分区 | 年份 |
植物 | 番茄 | DOI: 10.1073/pnas.2310163120 | Proc Natl Acad Sci U S A | 9.4 | 1 | 2023 |
拟南芥叶 | DOI: 10.1016/j.devcel.2022.04.011 | Dev Cell | 10.7 | 1 | 2022 | |
花生 | DOI: 10.1111/pbi.13884 | Plant Biotechnol J | 11.2 | 1 | 2022 | |
马齿苋和马蹄苋 | DOI: 10.1126/sciadv.abn2349 | Sci Adv | 11.7 | 1 | 2022 | |
兰花 | DOI: 10.1093/nar/gkac773 | Nucleic Acids Res | 16.7 | 1 | 2022 | |
杨树 | DOI: 10.1016/j.molp.2023.03.005 | Mol Plant | 17.1 | 1 | 2023 | |
大豆根瘤成熟 | DOI: 10.1038/s41477-023-01387-z | Nat Plants | 15.8 | 1 | 2023 | |
宿主-细菌-真菌相互作用 | DOI: 10.1038/s41587-023-01979-2 | Nat Biotechnol | 33.1 | 1 | 2024 | |
玉米籽粒发育过程 | DOI: 10.1038/s41467-023-43006-7 | Nat Commun | 14.7 | 1 | 2023 | |
杨树初中级生长 | DOI: 10.1016/j.xplc.2023.100665 | Plant Commun | 9.4 | 1 | 2023 | |
石松根进化 | DOI: 10.1016/j.cub.2023.08.030 | Curr Biol | 8.1 | 1 | 2023 | |
水稻 | DOI: 10.1016/j.devcel.2024.05.016 | Dev Cell | 10.7 | 1 | 2024 | |
玉米穗发育 | DOI: 10.1038/s41477-024-01683-2 | Nat Plants | 15.8 | 1 | 2024 | |
菠萝光合作用 | DOI: 10.1111/tpj.13630 | Plant J | 6.2 | 1 | 2017 | |
人参 | DOI: 10.1038/srep18283 | Sci Rep | 3.8 | 1 | 2015 | |
杜鹃花 | DOI: 10.3390/genes15111482 | Genes (Basel) | 2.8 | 2 | 2024 | |
茶树碱 | DOI: 10.1186/s13062-023-00377-7 | Biol Direct | 5.7 | 1 | 2023 | |
水稻 | DOI: 10.1111/nph.12577 | New Phytol | 8.3 | 1 | 2014 | |
拟南芥-灰葡萄孢菌相互作用 | DOI: 10.1007/s11033-011-1185-4 | Mol Biol Rep | 2.6 | 3 | 2012 | |
樱桃 | DOI: 10.1111/tpj.15612 | Plant J | 6.2 | 1 | 2022 | |
玉米茎尖 | DOI: 10.1093/plphys/kiab601 | Plant Physiol | 6.6 | 1 | 2022 | |
发芽大麦粒 | DOI: 10.1093/nar/gkad521 | Nucleic Acids Res | 16.7 | 1 | 2023 | |
百脉根根瘤器官 | DOI: 10.1038/s41467-024-50737-8 | Nat Commun | 14.7 | 1 | 2024 | |
大麦根 | DOI: 10.1186/s12864-024-10002-0 | BMC Genomics | 3.5 | 2 | 2024 | |
竹笋 | DOI: 10.1111/nph.20059 | New Phytol | 8.3 | 1 | 2024 | |
杂 | 斑马鱼 | DOI: 10.1016/j.devcel.2022.04.009 | Dev Cell | 10.7 | 1 | 2022 |
大西洋鲑鱼 | DOI: 10.1007/s00441-023-03850-x | Cell Tissue Res | 3.2 | 3 | 2024 | |
奶牛胎盘 | DOI: 10.24272/j.issn.2095-8137.2023.205 | Zool Res | 4.0 | 1 | 2024 | |
涡虫再生 | DOI: 10.1038/s41467-023-39016-0 | Nat Commun | 14.7 | 1 | 2023 | |
兔颅内血管 | DOI: 10.1177/15910199221088691 | Interv Neuroradiol | 1.5 | 3 | 2022 | |
鸽子 | DOI: 10.1371/journal.pgen.1010746 | PLoS Genet | 4.0 | 1 | 2023 | |
牛 | DOI: 10.1152/physiolgenomics.00064.2023 | Physiol Genomics | 2.5 | 2 | 2023 | |
寄生虫 | DOI: 10.1038/s41467-023-42237-y | Nat Commun | 14.7 | 1 | 2023 | |
猕猴下丘脑 | DOI: 10.1016/j.cmet.2024.01.003 | Cell Metab | 27.7 | 1 | 2024 | |
家蚕 | DOI: 10.1016/j.celrep.2024.114460 | Cell Rep | 7.5 | 1 | 2024 | |
蜘蛛网 | DOI: 10.1126/sciadv.adn0597 | Sci Adv | 11.7 | 1 | 2024 | |
寄生扁虫 | DOI: 10.1038/s41467-024-53215-3 | Nat Commun | 14.7 | 1 | 2024 | |
果蝇 | DOI: 10.1016/j.devcel.2022.04.006 | Dev Cell | 10.7 | 1 | 2022 |