jalview批量计算蛋白/核酸序列之间的identity，并展示到excel进行筛选

1-场景： 有100个序列A1、A2…A100，需要比较序列俩俩之间的identity，以保持序列的不冗余程度

2-用jalview进行比对

一对一对地比较则有 100*（100+1）/2=5050对，能比较到山无棱天地合的时候
可以用软件jalview（免费软件、官网download即可）进行比对。
1-打开fasta/aln文件

2-选中所有序列，然后点击caculate-pairwase alignment进行比对

3-这将生成所有选中序列的排列组合的pairwise alignment文件

当序列不多的时候，之间读取Percentage ID即可，但是当序列多的时候，挨个读取选择非常麻烦。

用python读取jalview的pairwise alignment文件

path=